Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10835
- Subject:
- XM_011535715.3
- Aligned Length:
- 1395
- Identities:
- 1098
- Gaps:
- 297
Alignment
Query 1 ATGCCTTATTTTACAAGACTCATTTTGTTCTTGTTTTGCTTGATGGTTCTCGTGGAGAGCAGAAAACCCAAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGCGATGGACAGGGCAGGTGGAAATGCCCAAGCCAAGTCACTTATATAAGAAGAACCTTGATGTGACCAAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCCGGAAGGGAAAGCCTCAGCAGCTTCTCAGAGTGGACGAGCACGACTTCAGCATGAGACCCGCCTTCGGAGGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATGGACTTCAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAAGAGCATGA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -ATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAAGAGCATGA 73
Query 371 CCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGATCGTTCACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGATCGTTCACT 147
Query 445 CATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATGAGGATTAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATGAGGATTAC 221
Query 519 GGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGAGCTGGAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGAGCTGGAGA 295
Query 593 GCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAGATGAGAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAGATGAGAAG 369
Query 667 ATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCTG 443
Query 741 GTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATATTTCCCTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATATTTCCCTG 517
Query 815 CCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAGTTTCACTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAGTTTCACTG 591
Query 889 GGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTCTCCTACGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTCTCCTACGT 665
Query 963 CAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGCGGCTGTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGCGGCTGTCA 739
Query 1037 ACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTGGAATGCTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTGGAATGCTT 813
Query 1111 CATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTACCCCAGAAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTACCCCAGAAG 887
Query 1185 CCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGCCAACGCTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGCCAACGCTG 961
Query 1259 CCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTGACAAATAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTGACAAATAC 1035
Query 1333 TCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC 1395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC 1098