Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10875
• Subject: NM_002117.6
• Aligned Length: 1116
• Identities: 1048
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGCGGGTGATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCGG  74
            ||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCTGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCACTTCATCGCAGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222

Query  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGACTGACCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGACCG  296

Query  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCAGGTCTCACATCATCCAGAGGATGTATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|.||||||||||||.||
Sbjct  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTCTG  370

Query  371  GCTGCGACGTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTACGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444

Query  445  GCCCTGAACGAGGATCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC  518
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAGGC  518

Query  519  GGCCCGTGAGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCCTGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGAAGA  592
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592

Query  593  ATGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATCCCGTCTCTGACCATGAG  666
            |.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATGAG  666

Query  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGTGGGATGGGGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA  740

Query  741  CCAAACTCAGGACACTGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814
            |||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814

Query  815  TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCACCCTG  888
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCCTG  888

Query  889  AGATGGGAGCCGTCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGCTGTCCT  962
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  889  AGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGTTGTCCT  962

Query  963  AGCTGTCCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGGCATTTTCTTCCCACAGGTG  1036
            |||||||||.|||||||||||..|.|.|.|||||||||||||||||||||                  ||||||
Sbjct  963  AGCTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCT------------------CAGGTG  1018

Query 1037  GAAAAGGAGGGAGCTGCTCTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCTTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1019  GAAAAGGAGGGAGCTGCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCACTTGT  1092

Query 1111  AAAGCC  1116
            ||||||
Sbjct 1093  AAAGCC  1098