Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10887
• Subject: NM_002137.4
• Aligned Length: 1023
• Identities: 747
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGGAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTT  74

Query   75  GAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACTGTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACTGTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAA  148

Query  149  GAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAGGTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAGGTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATT  222

Query  223  GATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGT  296

Query  297  GAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTGAGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTGAGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATG  370

Query  371  GAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTT  444

Query  445  GATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAAATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAAATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAG  518

Query  519  AAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGC------------------------------------------------  544
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  519  AAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTTCAGAGTTCTAGGAGTGGAAGAGGAGGCAACTTTGGCTTTG  592

Query  545  --------------------------------------------------------------------------  544
                                                                                      
Sbjct  593  GGGATTCACGTGGTGGCGGTGGAAATTTCGGACCAGGACCAGGAAGTAACTTTAGAGGAGGATCTGATGGATAT  666

Query  545  -----------------------------------------AGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAG  577
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAGTGGACGTGGATTTGGGGATGGCTATAATGGGTATGGAGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAG  740

Query  578  CCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTGGAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACG  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTGGAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACG  814

Query  652  GAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGAAGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGAAGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAG  888

Query  726  CAACCTTCTAACTACGGTCCAA----------------------------------------------------  747
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  889  CAACCTTCTAACTACGGTCCAATGAAGAGTGGAAACTTTGGTGGTAGCAGGAACATGGGGGGACCATATGGTGG  962

Query  748  -------------------------------------------------------------  747
                                                                         
Sbjct  963  AGGAAACTATGGTCCAGGAGGCAGTGGAGGAAGTGGGGGTTATGGTGGGAGGAGCCGATAC  1023