Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10887
• Subject: NM_182650.4
• Aligned Length: 934
• Identities: 659
• Gaps: 218

Alignment

Query   1  ATGGAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGAAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTT  74

Query  75  GAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACTGTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAA  148
           |||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGTTATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAA  148

Query 149  GAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAGGTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATT  222
           ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 149  GAGGATTTGGCTTTGTAACTTTCTCATCCATGGCCGAGGTTGACGCTGCCATGGCTGCAAGGCCCCATTCCATT  222

Query 223  GATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGT  296
           |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 223  GATGGCAGGGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAGGAGTCTGGAAAACCAGGAGCCCATGTGACTGT  296

Query 297  GAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTGAGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATG  370
           ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 297  GAAGAAGCTGTTTGTTGGTGGAATTAAGGAAGATACTGAGGAACACCACCTTAGAGATTACTTTGAAGAGTATG  370

Query 371  GAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTT  444
           |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GAAAAATTGATACTATTGAAATAATTACCGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTT  444

Query 445  GATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAAATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAG  518
           ||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 445  GATGACCATGATCCTGTGGATAAAATTGTCTTGCAAAAATATCACACCATAAATGGTCACAATGCAGAAGTTAG  518

Query 519  AAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAGGACC---------------------------------------  553
           ||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||                                       
Sbjct 519  AAAGGCATTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTCCAAAGTTCTAGGAGTGGAAGAGGAGGAAACTTTGGTTTTG  592

Query 554  -------------TGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGA---------AGAGGAGGA  605
                        |||.|||||||||||||||     ||       .|||..||||         ||.||.|||
Sbjct 593  GGGATTCTCGTGGTGGCGGTGGCAATTTTGGA-----CC-------AGGACCAGGAAGCAACTTTAGGGGGGGA  654

Query 606  TATGGTGG---TGGA---GGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGG-------GGGCTACGGAGGTGGTTATGACA  666
           |.||.|||   .|||   ||||.|||||.|||      ||.|||       ||| ||.|||||.||       |
Sbjct 655  TCTGATGGATACGGAAGTGGACGTGGATTTGG------GGATGGCTATAATGGG-TATGGAGGAGG-------A  714

Query 667  ACTATGGAGGAGGAAATTATGGAAGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTAC  740
           .||     ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 715  CCT-----GGAGGAAATTATGGAAGTGGAAGTTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAGCCTTCTAACTAT  783

Query 741  GGTCCAA-------------------------------------------------------------------  747
           |||||||                                                                   
Sbjct 784  GGTCCAATGAAGAGTGGAAACTTTGGGGGTAGCAGGAACATGGGAGGACCATATGGTGGAGGGAACTATGGTCC  857

Query 748  ----------------------------------------------  747
                                                         
Sbjct 858  TGGAGGAAGTGGAGGAAGTGGTGGCTATGGTGGAAGGAGCAGATAT  903