Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11022
• Subject: NM_033018.4
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1344
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ------------------ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGA----------------  40
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct    1  ATGCAGTCCGAGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCG  74

Query   41  --------------------------------------------------------------------------  40
                                                                                      
Sbjct   75  AGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACC  148

Query   41  ------------------------------------------------------CACTCAGCTCTGCACCAGAG  60
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAG  222

Query   61  ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGT  296

Query  135  GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCC  370

Query  209  TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGAC  444

Query  283  AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAA  518

Query  357  GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGG  592

Query  431  CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAG  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAG  666

Query  505  GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGA  740

Query  579  GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGT  814

Query  653  TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAG  888

Query  727  AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAAC  962

Query  801  AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACT  1036

Query  875  CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGC  1110

Query  949  TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCAT  1184

Query 1023  CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCC  1258

Query 1097  GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAG  1332

Query 1171  GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATT  1406

Query 1245  TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAG  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAG  1480

Query 1319  CTTTCCGCGTGGTGGACACCGAGTTC  1344
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTTCCGCGTGGTGGACACCGAGTTC  1506