Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11022
- Subject:
- XM_011543922.1
- Aligned Length:
- 1636
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 308
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCGCGTCCCCTCCCGCTGCGGACGGGTCCTTTGGTACATGCAGTCCGAGGTCCTCAGGATATAGCCGTGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------ATGGATCGGATGAAGAAGA 19
|||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTAAACACAGAAATCTACCCTGGCGGAGCTGATCTTCTAGTTGTGGCGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGA 148
Query 20 TCAAACGGCAGCTGTCAATGA----------------------------------------------------- 40
|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATA 222
Query 41 -------------------------------------------------------------------------- 40
Sbjct 223 GGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACT 296
Query 41 -----------------CACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG 97
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG 370
Query 98 AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC 444
Query 172 CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA 518
Query 246 CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT 592
Query 320 CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC 666
Query 394 TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC 740
Query 468 ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA 814
Query 542 TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC 888
Query 616 TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA 962
Query 690 CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG 1036
Query 764 CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC 1110
Query 838 CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT 1184
Query 912 CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA 1258
Query 986 TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC 1332
Query 1060 AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT 1406
Query 1134 GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG 1480
Query 1208 AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC 1554
Query 1282 CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA------CCGAGTTC----- 1344
|||||||||||||||||||||||||||| ||.|| |||||||| || ||.|
Sbjct 1555 CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG----------TTGCC----GGTGGACAGCATGGCC--GTGCCAGCC 1612
Query 1345 -------- 1344
Sbjct 1613 TCCCACAC 1620