Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11046
• Subject: NM_198932.3
• Aligned Length: 2312
• Identities: 2023
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGAA  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGGCGGACGGAGGAGCAGCGAGTCAAGATGAGAGTTCAGCCGCGGCGGCAGCAGCAGCAGACTCAAGAATGAA  74

Query    6  CAATCCGTCAGAAACCAGTAAACCATCTATGGAGAGTGGAGATGGCAACACAGGCACACAAACCAATGGTCTGG  79
            .|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAATCCATCAGAAACCAATAAATCATCTATGGAGAGTGAAGATGCCAGCACAGGCACACAAACCAATGGTCTGG  148

Query   80  ACTTTCAGAAGCAGCCTGTGCCTGTAGGAGGAGCAATCTCAACAGCCCAGGCGCAGGCTTTCCTTGGACATCTC  153
            ||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  ACTTTCAGAAACAGCCCGTGCCCGTTGGAGGAGCGATCTCCACAGCCCAGGCCCAGGCCTTCCTCGGACATCTT  222

Query  154  CATCAGGTCCAACTCGCTGGAACAAGTTTACAGGCTGCTGCTCAGTCTTTAAATGTACAGTCTAAATCTAATGA  227
            ||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct  223  CACCAGGTCCAGCTAGCTGGGACAAGTTTACAGGCTGCTGCTCAGTCTTTAAATGTACAGTCTAAATCCAGTGA  296

Query  228  AGAATCGGGGGATTCGCAGCAGCCAAGCCAGC---CTTCCCAGCAGCCTTCAGTGCAGGCAGCCATTCCCCAGA  298
            |||.|||||.||||||||||||.|.|||||||   |||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGTCGGGAGATTCGCAGCAGTCGAGCCAGCCTTCTTCCCAGCCGCCTTCAGTGCAGTCAGCCATTCCCCAGA  370

Query  299  CCCAGCTTATGCTAGCTGGAGGACAGATAACTGGGCTTACTTTGACGCCTGCCCAGCAACAGTTACTACTCCAG  372
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  CCCAGCTAATGCTGGCTGGGGGACAGATAACTGGGCTCACGTTGACCCCAGCCCAGCAACAGTTACTGCTACAG  444

Query  373  CAGGCACAGGCACAGGCACAGCTGCTGGCTGCTGCAGTGCAGCAGCACTCCGCCAGCCAGCAGCACAGTGCTGC  446
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGCGCAGGCCCAGGCCCAGCTCCTGGCCGCTGCAGTGCAGCAACACTCCGCCAGCCAACAGCACAGTGCTGC  518

Query  447  TGGAGCCACCATCTCCGCCTCTGCTGCCACGCCCATGACGCAGATCCCCCTGTCTCAGCCCATACAGATCGCAC  520
            |||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  TGGGGCCACCATCTCAGCCTCCGCCGCCACACCCATGACGCAGATCCCCCTGTCTCAGCCCATACAGATTGCAC  592

Query  521  AGGATCTTCAACAACTGCAACAGCTTCAACAGCAGAATCTCAACCTGCAACAGTTTGTGTTGGTGCATCCAACC  594
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  AGGATCTTCAACAATTGCAACAGCTTCAGCAGCAAAATCTCAACTTGCAACAGTTTGTGTTGGTGCACCCAACC  666

Query  595  ACCAATTTGCAGCCAGCGCAGTTTATCATCTCACAGACGCCCCAGGGCCAGCAGGGTCTCCTGCAAGCGCAAAA  668
            |||||..||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCAACCTGCAACCAGCACAGTTTATCATCTCACAGACCCCCCAGGGCCAGCAGGGTCTCCTGCAAGCGCAAAA  740

Query  669  TCTTCTAACGCAACTACCTCAGCAAAGCCAAGCCAACCTCCTACAGTCGCAGCCAAGCATCACCCTCACCTCCC  742
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TCTTTTAACGCAACTACCTCAGCAAAGCCAAGCCAACCTCCTACAGCCACAGCCAAGCATCACCCTCACGTCCC  814

Query  743  AGCCAGCAACCCCAACACGCACAATAGCAGCAACCCCAATTCAGACACTTCCACAGAGCCAGTCAACACCAAAG  816
            ||||..|.||||||||.|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCTACCACCCCAACTCGCACAATAGCAGCAGCCTCAGTTCAGACACTTCCACAGAGCCAGTCAACACCAAAG  888

Query  817  CGAATTGATACTCCCAGCTTGGAGGAGCCCAGTGACCTTGAGGAGCTTGAGCAGTTTGCCAAGACCTTCAAACA  890
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CGAATTGACACTCCCAGCTTGGAGGAGCCCAGTGACCTTGAGGAGCTTGAGCAGTTTGCCAAGACTTTCAAACA  962

Query  891  AAGACGAATCAAACTTGGATTCACTCAGGGTGATGTTGGGCTCGCTATGGGGAAACTATATGGAAATGACTTCA  964
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGACGAATCAAACTTGGATTCACTCAGGGTGATGTTGGGCTCGCTATGGGGAAATTATATGGAAATGACTTCA  1036

Query  965  GCCAAACTACCATCTCTCGATTTGAAGCCTTGAACCTCAGCTTTAAGAACATGTGCAAGTTGAAGCCACTTTTA  1038
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037  GCCAAACCACCATCTCTCGCTTTGAAGCCTTGAACCTCAGCTTTAAGAACATGTGCAAGTTAAAGCCCCTTTTA  1110

Query 1039  GAGAAGTGGCTAAATGATGCAGAGAACCTCTCATCTGATTCGTC--CCTCTCCAGCCCAAGTGCCCTGAATTCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|  |.|||  |||||||||||..||||||||
Sbjct 1111  GAGAAGTGGCTAAATGATGCAGAGAACCTCTCATCTGATTCTACAGCATCT--AGCCCAAGTGCTTTGAATTCT  1182

Query 1111  CCAGGAAT------TGAGGGCTTGAGCCGTAGGAGGAAGAAACGCACCAGCATAGAGACCAACATCCGTGTGGC  1178
            ||||||.|      |||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  CCAGGATTGGGGGCTGAGGGCTTGAATCGTAGGAGGAAAAAACGCACCAGCATAGAGACCAACATCCGTGTGGC  1256

Query 1179  CTTAGAGAAGAGTTTCTTGGAGAATCAAAAGCCTACCTCGGAAGAGATCACTATGATTGCTGATCAGCTCAATA  1252
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct 1257  CTTAGAGAAGAGTTTCATGGAGAATCAAAAGCCTACCTCGGAAGACATCACCTTGATTGCTGAACAGCTCAATA  1330

Query 1253  TGGAAAAAGAGGTGATTCGTGTTTGGTTCTGTAACCGCCGCCAGAAAGAAAAAAGAATCAACCCACCAAGCAGT  1326
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1331  TGGAAAAGGAGGTGATTCGTGTTTGGTTTTGTAACCGCCGCCAGAAGGAGAAAAGAATCAACCCGCCCAGCAGT  1404

Query 1327  GGTGGGACCAGCAGCTCACCTATTAAAGCAATTTTCCCCAGCCCAACTTCACTGGTGGCGACCACACCAAGCCT  1400
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1405  GGTGGGACCAGCAGCTCACCTATCAAAGCAATTTTCCCCAGCCCAGCCTCATTGGTGGCAACCACTCCAAGCCT  1478

Query 1401  TGTGACTAGCAGTGCAGCAACTACCCTCACAGTCAGCCCTGTCCTCCCTCTGACCAGTGCTGCTGTGACGAATC  1474
            ||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1479  TGTGACAAGCAGTACGGCAACTACCCTCACAGTCAACCCTGTCCTCCCTTTAACCAGTGCTGCTGTGACTAATC  1552

Query 1475  TTTCAGTTACAGGCACTTCAGACACCACCTC---CAACAACACAGCAACCGTGATTTCCACAGCGCCTCCAGCT  1545
            |.||..|||||||||||.|||||.|.||.||   |||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1553  TCTCTCTTACAGGCACTACAGACTCGACGTCCAACAACAACACGGCCACGGTGATTTCCACAGCACCCCCTGCT  1626

Query 1546  TCCTCAGCAGTCACGTCCCCCTCTCTGAGTCCCTCCCCTTCTGCCTCAGCCTCCACCTCCGAGGCATCCAGTGC  1619
            ||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1627  TCCTCAGCAGTCACATCCCCTTCCTTGAGTCCCTCTCCCTCTGCCTCGGCCTCCACCTCAGAGGCCTCCAGTGC  1700

Query 1620  CAGTGAGACCAGCACAACACAGACCACCTCCACTCCTTTGTCCTCCCCTCTTGGGACCAGCCAGGTGATGGTGA  1693
            |||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||.|..||||||||||.||..||||||||||||||||||
Sbjct 1701  CAGTGAGACCAACACGACACAGACCACCTCCACGCCTCTTCCCTCCCCTCTCGGAGCCAGCCAGGTGATGGTGA  1774

Query 1694  CAGCATCAGGTTTGCAAACAGCAGCAGCTGCTGCCCTTCAAGGAGCTGCACAGTTGCCAGCAAATGCCAGTCTT  1767
            |..|..|.||.||.||.||||||||.||.|||   ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1775  CCACGCCCGGCTTACAGACAGCAGCCGCCGCT---CTCCAAGGAGCGGCACAGTTGCCAGCAAACGCCAGTCTT  1845

Query 1768  GCTGCCATGGCAGCTGCTGCAGGACTAAACCCAAGCCTGATGGCACCCTCACAGTTTGCGGCTGGAGGTGCCTT  1841
            |||||.|||||.||||||||.|||||.|.||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1846  GCTGCTATGGCTGCTGCTGCGGGACTCAGCCCAGGCCTCATGGCACCCTCACAGTTTGCTGCTGGAGGTGCCTT  1919

Query 1842  ACTCAGTCTGAATCCAGGGACCCTGAGCGGTGCTCTCAGCCCAGCTCTAATGAGCAACAGTACACTGGCAACTA  1915
            |||||||||.|.|||.|||||.|||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1920  ACTCAGTCTCAGTCCGGGGACTCTGGGCAGTGCTCTCAGCCCAGCCCTAATGAGCAACAGTACACTGGCAACGA  1993

Query 1916  TTCAAGCTCTTGCTTCTGGTGGCTCTCTTCCAATAACATCACTTGATGCAACTGGGAACCTGGTATTTGCCAAT  1989
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994  TTCAAGCTCTTGCTTCTAGTGGCTCTCTTCCAATAACGTCTCTGGATGCAACTGGGAACCTGGTATTTGCCAAT  2067

Query 1990  GCGGGAGGAGCCCCCAACATCGTGACTGCCCCTCTGTTCCTGAACCCTCAGAACCTCTCTCTGCTCACCAGCAA  2063
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068  GCAGGAGGAGCCCCGAACATCGTGACTGCACCTCTGTTCCTGAACCCTCAGAACCTCTCTCTGCTCACCAGCAA  2141

Query 2064  CCCTGTTAGCTTGGTCTCTGCCGCCGCAGCATCTGCAGGGAACTCTGCACCTGTAGCCAGCCTTCACGCCACCT  2137
            |||.||.||||||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||..||||||||||||.|||.|||
Sbjct 2142  CCCAGTAAGCTTGGTTTCTGCCGCTGCAGCCTCCACAGGGAACTCTGCACCTACAGCCAGCCTTCATGCCTCCT  2215

Query 2138  CCACCTCTGCTGAGTCCATCCAGAACTCTCTCTTCACAGTGGCCTCTGCCAGCGGGGCTGCGTCCACCACCACC  2211
            |||||||..|||||||||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||||||||.
Sbjct 2216  CCACCTCAACTGAGTCCATCCAGAGCTCTCTGTTCACAGTCGCCTCTGCCAGTGGGCCTGCTTCCACCACCACA  2289

Query 2212  ACCGCCTCCAAGGCACAG  2229
            .|.|||||||||||||||
Sbjct 2290  GCTGCCTCCAAGGCACAG  2307