Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11047
• Subject: NM_001207025.3
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1200
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74

Query   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148

Query  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222

Query  223  GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT  296

Query  297  AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370

Query  371  CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT  444

Query  445  CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACA--------------------  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  445  CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGGCCGTGACCCGCCCTAC  518

Query  499  ----------------------------CAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCA  544
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGCCCGACCCGCACCTCTCGCACCCGCAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCA  592

Query  545  GTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGT  666

Query  619  GATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCT  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCT  740

Query  693  CAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGT  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGT  814

Query  767  CTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGG  888

Query  841  AGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAA  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAA  962

Query  915  GCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCT  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCT  1036

Query  989  GCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCG  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCG  1110

Query 1063  GCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAG  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAG  1184

Query 1137  TCTGAGCA------------------------------------------------------------------  1144
            ||||||||                                                                  
Sbjct 1185  TCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCACCCCAGCCGGACAGCTGGAGGGGGTG  1258

Query 1145  ----------------------------------------------------------------------CAAC  1148
                                                                                  ||||
Sbjct 1259  GGGGCGGGGGCGGGGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAAC  1332

Query 1149  AGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCC----------------------  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1333  AGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCCTGAACCCCAGCACGGGCCCTGG  1406

Query 1201  -------------------------------  1200
                                           
Sbjct 1407  CCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT  1437