Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11047
- Subject:
- NM_001207026.1
- Aligned Length:
- 1401
- Identities:
- 1200
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA 74
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Sbjct 1 ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA 74
Query 75 CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT 148
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Sbjct 75 CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT 148
Query 149 CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA 222
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Sbjct 149 CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA 222
Query 223 GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT 296
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Sbjct 223 GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT 296
Query 297 AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG 370
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Sbjct 297 AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG 370
Query 371 CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT 444
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Sbjct 371 CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT 444
Query 445 CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACA-------------------- 498
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Sbjct 445 CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGGCCGTGACCCGCCCTAC 518
Query 499 ----------------------------CAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCA 544
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Sbjct 519 GCTGCCCGACCCGCACCTCTCGCACCCGCAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCA 592
Query 545 GTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGT 618
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Sbjct 593 GTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGT 666
Query 619 GATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCT 692
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Sbjct 667 GATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCT 740
Query 693 CAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGT 766
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Sbjct 741 CAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGT 814
Query 767 CTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGG 840
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Sbjct 815 CTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGG 888
Query 841 AGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAA 914
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Sbjct 889 AGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAA 962
Query 915 GCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCT 988
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Sbjct 963 GCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCT 1036
Query 989 GCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCG 1062
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Sbjct 1037 GCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCG 1110
Query 1063 GCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAG 1136
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Sbjct 1111 GCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAG 1184
Query 1137 TCTGAGCA------------------------------------------------------------------ 1144
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Sbjct 1185 TCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCACCCCAGCCGGACAGCTGGAGGGGGTG 1258
Query 1145 ----------------------------------------------------------------------CAAC 1148
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Sbjct 1259 GGGGCGGGGGCGGGGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAAC 1332
Query 1149 AGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCC----------------- 1200
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Sbjct 1333 AGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCCTGAACCCCAGCACGGGG 1401