Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11047
- Subject:
- XM_006539662.3
- Aligned Length:
- 1405
- Identities:
- 1124
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGGTTCACTC-----CAGC-----------ATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG 58
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Sbjct 1 ATGG------CGAAGACAGCGGCGCCTACCGATGGGAGCAGC-GAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG 67
Query 59 AGAAGCAAGGTCTGGACTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAAC 132
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Sbjct 68 AGAAGCAAAGTCTGGACTCCCCGTCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCCGACATTAACCATCAGAAC 141
Query 133 CCCCAAAATAAGACCTCCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAG 206
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Sbjct 142 CCCCAGAATAAAGCGTCCCCATTCTCTGTGTCCCCAACTGGCCCCAGCACCAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAG 215
Query 207 TGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGT 280
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Sbjct 216 TGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACCCCCGCCCCCCCAGCCGGCTCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGC 289
Query 281 TGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCAC 354
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Sbjct 290 TGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTCCCCGGCCAC 363
Query 355 CACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAA 428
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Sbjct 364 CACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTCCTGCTGCCACAGGCACAGCAGAGTCAGCCAGGCCTGCTACCAACGCCAAA 437
Query 429 TCTATTCCAGCTACCTCAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGC 502
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Sbjct 438 TCTATTCCAGCTACCTCAACAAACCCAGGGAGCTCTCCTGACCTCCCAGCCCCGGGCTGGGCTTCCTACACAGC 511
Query 503 CCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGC 576
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Sbjct 512 CCCCGAAATGCTTGGAGCCGCCCTCCCACCCGGAGGAGCCCAGCGATCTGGAGGAGCTGGAACAGTTTGCTCGC 585
Query 577 ACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGG 650
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Sbjct 586 ACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACACAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTATGG 659
Query 651 CAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCA 724
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Sbjct 660 CAACGACTTCAGCCAAACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGTAAACTCA 733
Query 725 AGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAG 798
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Sbjct 734 AGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGACGCAGAGACTATGTCTGTGGATTCAAGCCTACCCAGCCCAAACCAG 807
Query 799 CTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAA 872
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Sbjct 808 CTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGGCTGCCGGGGCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACGAA 881
Query 873 CGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCG 946
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Sbjct 882 TGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTCCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCAG 955
Query 947 AGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAAC 1020
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Sbjct 956 AGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAAC 1029
Query 1021 CCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCA 1094
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Sbjct 1030 CCTTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCGGGAAAGCCGACCAGCTACAGCCCTCACCTGGTCACACCCCA 1103
Query 1095 AGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA------------------------ 1144
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Sbjct 1104 AGGGGGCGCAGGGACCTTACCATTGTCCCAAGCTTCTAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAG 1177
Query 1145 -------------------------------------------------------------------------- 1144
Sbjct 1178 CTGTGGGGACGCTCCATCCCAGCCGGACAGCAGGAGGGGGTGGGGGTGGGGGCGGAGCTGCGCCCCCCCTCAAT 1251
Query 1145 --------------------------------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTC 1180
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Sbjct 1252 TCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCGAGCCCTCAAGGCAGCCACTC 1325
Query 1181 GGCTATCGGCTTGTCAGGCC----------------------------------------------------- 1200
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Sbjct 1326 GGCTATTGGCTTGTCGGGCCTGAACCCCAGCGCGGGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT 1398