Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11047
• Subject: XM_011527041.3
• Aligned Length: 1503
• Identities: 1200
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74

Query   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148

Query  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAA--------------------------------------  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGGTGGGCATTCTCTCTGGCCTCCACTTAACATTCTGG  222

Query  185  ----------------------------AGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC  230
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTCCCGGACCCTGCCTCTCTCCCCCCCAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC  296

Query  231  CCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG  370

Query  305  ACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC  444

Query  379  CTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCTCAGCAAAC  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCTCAGCAAAC  518

Query  453  CCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACA----------------------------  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  519  CCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGGCCGTGACCCGCCCTACGCTGCCCG  592

Query  499  --------------------CAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTG  552
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCGCACCTCTCGCACCCGCAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTG  666

Query  553  GAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGG  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGG  740

Query  627  CCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGA  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGA  814

Query  701  GCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGAC  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGAC  888

Query  775  TCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAA  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAA  962

Query  849  GAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCT  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCT  1036

Query  923  CAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGG  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGG  1110

Query  997  CGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTA  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTA  1184

Query 1071  CAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA  1258

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1259  CAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCACCCCAGCCGGACAGCTGGAGGGGGTGGGGGCGGG  1332

Query 1145  --------------------------------------------------------------CAACAGCACAAA  1156
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGGGGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAA  1406

Query 1157  CCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCC------------------------------  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct 1407  CCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCCTGAACCCCAGCACGGGCCCTGGCCTCTGGT  1480

Query 1201  -----------------------  1200
                                   
Sbjct 1481  GGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT  1503