Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11149
- Subject:
- XM_017019889.1
- Aligned Length:
- 2481
- Identities:
- 1821
- Gaps:
- 660
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGGATACCTATTCCCCTCCACATCGCACATCGTGTTTTATGGAGTTTAGAGCTGAGGAAACTTTGGTCGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTGCCAGGACGTTCGCACCACTTTGCGGAAAGCACGAGCTAACAGTGAGACCGACAGAGTTCAGTTGGAGACGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCATAGGTGGCTGCTGTGACAAAGGGAAATTGTGCTTTTCCAGCATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAG 222
Query 1 ---------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAG 65
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAG 296
Query 66 CAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCA 139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCAT------------- 357
Query 140 ACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACT 213
Sbjct 358 -------------------------------------------------------------------------- 357
Query 214 TCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTC 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 ------------------GAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTC 413
Query 288 ACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAAC 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 ACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAAC 487
Query 362 GGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAG 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 GGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAG 561
Query 436 CCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGG 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 CCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGG 635
Query 510 GAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACC 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 GAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACC 709
Query 584 AGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAG 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 AGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAG 783
Query 658 AAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACA 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 AAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACA 857
Query 732 GCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCG 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 GCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCG 931
Query 806 TATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTAT 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 TATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTAT 1005
Query 880 AAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 AAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACC 1079
Query 954 AGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGA 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGA 1153
Query 1028 AGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACA 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 AGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACA 1227
Query 1102 AACAGCCCACCACCCAAAAGC----------------------------------------------------- 1122
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 AACAGCCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCACAGCCACTGAACCTATCAGCTAAACCCAAGACCTCTGA 1301
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1302 TGGCAAATCACCCACATCACCCACCTCTCCCCATATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCAGGCCCCCTCA 1375
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1376 AAGCCTCTGTCCCAGCAGCGTTAGCTAGTCCTTCAGCCAGAGTTAGCACAATAGGTTACTTAAATGACCATGAT 1449
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1450 GCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGGCAAATGAAGGAGCAACTCCGACGGGAACAACAGGTGCTTGATGG 1523
Query 1123 -------------------------------------------------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTC 1147
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 GAAGGTGGCTGTTGTGAATAGTCTGGGTCTCAATAACTGCCGAACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTC 1597
Query 1148 TGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGT 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 TGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGT 1671
Query 1222 GGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGA 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 GGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGA 1745
Query 1296 ACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCT 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 ACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCT 1819
Query 1370 TTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAA 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820 TTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAA 1893
Query 1444 CAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCC 1517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894 CAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCC 1967
Query 1518 CAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACA 1591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 CAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACA 2041
Query 1592 GGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTG 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 GGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTG 2115
Query 1666 TACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116 TACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAG 2189
Query 1740 CCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGA 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2190 CCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGA 2263
Query 1814 TACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTAT 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 TACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTAT 2337
Query 1888 GGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 GGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 2376