Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11149
• Subject: XM_017019901.1
• Aligned Length: 2250
• Identities: 1821
• Gaps: 429

Alignment

Query    1  ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA  74

Query   75  AGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct   75  AGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCAT----------------------  126

Query  149  ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCAC  222
                                                                                      
Sbjct  127  --------------------------------------------------------------------------  126

Query  223  AATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  ---------GAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA  191

Query  297  GGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  GGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGG  265

Query  371  GCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  GCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAA  339

Query  445  ACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  ACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGG  413

Query  519  CGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  CGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCA  487

Query  593  GCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  GCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGT  561

Query  667  CAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  CAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACA  635

Query  741  CAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  CAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTC  709

Query  815  CTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGA  783

Query  889  TGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  TGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGG  857

Query  963  CCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAG  931

Query 1037  GCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  GCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCA  1005

Query 1111  CCACCCAAAAGC--------------------------------------------------------------  1122
            ||||||||||||                                                              
Sbjct 1006  CCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCACAGCCACTGAACCTATCAGCTAAACCCAAGACCTCTGATGGCAAATC  1079

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1080  ACCCACATCACCCACCTCTCCCCATATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCAGGCCCCCTCAAAGCCTCTG  1153

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1154  TCCCAGCAGCGTTAGCTAGTCCTTCAGCCAGAGTTAGCACAATAGGTTACTTAAATGACCATGATGCTGTCACC  1227

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1228  AAGGCAATCCAAGAAGCTCGGCAAATGAAGGAGCAACTCCGACGGGAACAACAGGTGCTTGATGGGAAGGTGGC  1301

Query 1123  ----------------------------------------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGC  1156
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  TGTTGTGAATAGTCTGGGTCTCAATAACTGCCGAACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGC  1375

Query 1157  AACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCT  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  AACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCT  1449

Query 1231  GATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACAT  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  GATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACAT  1523

Query 1305  AAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  AAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACA  1597

Query 1379  TGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATAT  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  TGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATAT  1671

Query 1453  TATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAA  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  TATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAA  1745

Query 1527  GCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746  GCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGG  1819

Query 1601  AAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGA  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820  AAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGA  1893

Query 1675  GCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCC  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894  GCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCC  1967

Query 1749  TGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCG  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968  TGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCG  2041

Query 1823  AGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGAC  1896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042  AGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGAC  2115

Query 1897  AGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC  1926
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116  AGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC  2145