Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11241
• Subject: NM_014519.4
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1251
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGGGGGCCCTTGCAAGATTCCAGCTGGTATGAGCCTTCTGCAGAGCTAGTGCA  74

Query    1  -------ATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGA  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACTAGGATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGA  148

Query   68  TGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGT  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGT  222

Query  142  CAAGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCA  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCA  296

Query  216  ACTACGAGTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGC  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTACGAGTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGC  370

Query  290  TGGAACAATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAACAATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAG  444

Query  364  GAGGCTGTGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGG  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCTGTGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGG  518

Query  438  ACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCC  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCC  592

Query  512  AGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGAT  666

Query  586  GGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGA  740

Query  660  AAAACTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAACTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCA  814

Query  734  AAGCGGAGAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATT  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCGGAGAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATT  888

Query  808  CCCACAGGGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCACAGGGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCA  962

Query  882  CCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACC  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACC  1036

Query  956  TCGGTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGGTCAGCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGG  1110

Query 1030  GGTGCTCATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGC  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTGCTCATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGC  1184

Query 1104  CTTTAGTCAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAAT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTTAGTCAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAAT  1258

Query 1178  GTGGGAAAGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGGGAAAGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1332