Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11376
- Subject:
- XM_017020242.1
- Aligned Length:
- 3341
- Identities:
- 1893
- Gaps:
- 1435
Alignment
Query 1 ATGCCGGCCGCCGGGAGTAACGAGCCGGACGGCGTCCTCAGCTATCAGAGACCAGATGAAGAAGCTGTGGTGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCAGGGTGGGACCAGTACAATTCTCAACATTCACTATGAAAAAGAAGAGCTGGAAGGTCACAGAACTCTGTATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGGAGTTCGGATGCCGCTTGGCCGGCAGAGCCATCGGCATCACCGCACTCATGGCCAGAAGCACCGGAGACGA 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------ATGCCGCTTGGCCGGCAGAGCCATCGGCATCACCGCACTCATGGCCAGAAGCACCGGAGACGA 63
Query 223 GGGCGGGGCAAAGGAGCCAGCCAGGGGGAGGAAGGCCTGGAAGCCCTGGCCCACGACACACCATCTCAGCGTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GGGCGGGGCAAAGGAGCCAGCCAGGGGGAGGAAGGCCTGGAAGCCCTGGCCCACGACACACCATCTCAGCGTGT 137
Query 297 TCAGTTCATTCTTGGCACCGAGGAAGATGAAGAGCATGTGCCTCATGAGCTGTTTACAGAGCTGGATGAGATCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 138 TCAGTTCATTCTTGGCACCGAGGAAGATGAAGAGCATGTGCCTCATGAGCTGTTTACAGAGCTGGATGAGATCT 211
Query 371 GTATGAAAGAGGGAGAAGATGCTGAGTGGAAGGAAACAGCCAGGTGGCTGAAGTTTGAAGAAGATGTTGAAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 GTATGAAAGAGGGAGAAGATGCTGAGTGGAAGGAAACAGCCAGGTGGCTGAAGTTTGAAGAAGATGTTGAAGAT 285
Query 445 GGGGGAGAACGCTGGAGCAAGCCTTATGTGGCAACCCTTTCATTGCACAGCCTGTTTGAGCTAAGGAGCTGCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 GGGGGAGAACGCTGGAGCAAGCCTTATGTGGCAACCCTTTCATTGCACAGCCTGTTTGAGCTAAGGAGCTGCCT 359
Query 519 TATTAATGGAACAGTCCTCCTGGATATGCATGCAAATAGCATAGAAGAAATTTCAGACCTGATCCTGGATCAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TATTAATGGAACAGTCCTCCTGGATATGCATGCAAATAGCATAGAAGAAATTTCAGACCTGATCCTGGATCAGC 433
Query 593 AAGAACTGTCCAGTGACCTGAATGACAGCATGAGGGTTAAAGTGCGGGAAGCCCTTCTCAAAAAGCATCATCAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 AAGAACTGTCCAGTGACCTGAATGACAGCATGAGGGTTAAAGTGCGGGAAGCCCTTCTCAAAAAGCATCATCAT 507
Query 667 CAGAATGAAAAGAAGAGAAACAACCTCATTCCCATTGTTCGCTCCTTTGCTGAGGTTGGCAAGAAGCAGTCTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 CAGAATGAAAAGAAGAGAAACAACCTCATTCCCATTGTTCGCTCCTTTGCTGAGGTTGGCAAGAAGCAGTCTGA 581
Query 741 TCCTCATTTGATGGATAAACATGGTCAAACCGTGTCTCCTCAGTCTGTTCCAACTACAAATCTTGAAGTAAAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 TCCTCATTTGATGGATAAACATGGTCAAACCGTGTCTCCTCAGTCTGTTCCAACTACAAATCTTGAAGTAAAAA 655
Query 815 ATGGAGTGAATTGTGAACATAGTCCTGTGGATTTAAGCAAGGTAGACCTTCATTTCATGAAAAAAATTCCTACT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 ATGGAGTGAATTGTGAACATAGTCCTGTGGATTTAAGCAAGGTAGACCTTCATTTCATGAAAAAAATTCCTACT 729
Query 889 GGGGCCGAGGCCTCCAATGTCCTGGTTGGAGAGGTGGATATTTTGGACCGTCCCATTGTTGCCTTTGTGAGGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 GGGGCCGAGGCCTCCAATGTCCTGGTTGGAGAGGTGGATATTTTGGACCGTCCCATTGTTGCCTTTGTGAGGCT 803
Query 963 GTCTCCAGCTGTTCTTCTCTCAGGCCTAACAGAAGTGCCAATCCCAACAAGATTTTTGTTTATCTTATTGGGTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 GTCTCCAGCTGTTCTTCTCTCAGGCCTAACAGAAGTGCCAATCCCAACAAGATTTTTGTTTATCTTATTGGGTC 877
Query 1037 CAGTAGGGAAAGGTCAGCAGTACCATGAGATTGGCAGATCCATGGCCACCATCATGACAGATGAGATTTTTCAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 CAGTAGGGAAAGGTCAGCAGTACCATGAGATTGGCAGATCCATGGCCACCATCATGACAGATGAGATTTTTCAT 951
Query 1111 GACGTAGCATATAAGGCAAAAGAGCGAGATGATCTCCTGGCGGGGATTGATGAGTTCCTAGACCAGGTGACGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 GACGTAGCATATAAGGCAAAAGAGCGAGATGATCTCCTGGCGGGGATTGATGAGTTCCTAGACCAGGTGACGGT 1025
Query 1185 GCTCCCTCCAGGAGAGTGGGATCCCTCCATTAGAATTGAGCCACCCAAAAATGTCCCTTCCCAGGAGAAAAGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 GCTCCCTCCAGGAGAGTGGGATCCCTCCATTAGAATTGAGCCACCCAAAAATGTCCCTTCCCAGGAGAAAAGGA 1099
Query 1259 AAATGCCTGGAGTTCCAAATGGAAATGTTTGCCACATAGAACAGGAACCACATGGGGGTCACAGTGGGCCAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 AAATGCCTGGAGTTCCAAATGGAAATGTTTGCCACATAGAACAGGAACCACATGGGGGTCACAGTGGGCCAGAA 1173
Query 1333 CTTCAGCGCACTGGGCGGCTATTTGGGGGCTTGGTGCTGGACATCAAGCGGAAGGCCCCCTGGTACTGGAGCGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 CTTCAGCGCACTGGGCGGCTATTTGGGGGCTTGGTGCTGGACATCAAGCGGAAGGCCCCCTGGTACTGGAGCGA 1247
Query 1407 CTACCGAGATGCACTCAGCTTACAGTGTTTGGCTTCCTTTCTGTTCCTGTACTGTGCCTGCATGTCACCTGTCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CTACCGAGATGCACTCAGCTTACAGTGTTTGGCTTCCTTTCTGTTCCTGTACTGTGCCTGCATGTCACCTGTCA 1321
Query 1481 TCACCTTTGGGGGACTGCTTGGAGAAGCCACTGAGGGACGCATAAGTGCAATTGAATCCTTGTTTGGAGCTTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TCACCTTTGGGGGACTGCTTGGAGAAGCCACTGAGGGACGCATAAGTGCAATTGAATCCTTGTTTGGAGCTTCC 1395
Query 1555 ATGACTGGGATTGCTTATTCCTTGTTTGCGGGACAGGCTCTCACCATCCTGGGAAGTACTGGACCAGTGCTTGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 ATGACTGGGATTGCTTATTCCTTGTTTGCGGGACAGGCTCTCACCATCCTGGGAAGTACTGGACCAGTGCTTGT 1469
Query 1629 GTTTGAAAAGATTTTGTTCAAATTCTGCAAAGACTATGCTCTTTCATACCTCTCCCTGCGAGCTTGTATTGGAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 GTTTGAAAAGATTTTGTTCAAATTCTGCAAAGACTATGCTCTTTCATACCTCTCCCTGCGAGCTTGTATTGGAC 1543
Query 1703 TGTGGACCGCTTTCCTGTGTATTGTCCTTGTGGCAACTGATGCCAGTTCCCTTGTCTGCTACATTACCCGTTTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 TGTGGACCGCTTTCCTGTGTATTGTCCTTGTGGCAACTGATGCCAGTTCCCTTGTCTGCTACATTACCCGTTTC 1617
Query 1777 ACTGAAGAAGCATTTGCCTCCCTAATTTGCATTATTTTCATCTATGAAGCAATAGAAAAACTGATTCACCTGGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 ACTGAAGAAGCATTTGCCTCCCTAATTTGCATTATTTTCATCTATGAAGCAATAGAAAAACTGATTCACCTGGC 1691
Query 1851 AGAGACCTACCCCATCCACATGCACAGCCAGCTGGACCACCTTAGCCTCTATTACTGCAGGTGTACTCTGCCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 AGAGACCTACCCCATCCACATGCACAGCCAGCTGGACCACCTTAGCCTCTATTACTGCAGGTGTACTCTGCCAG 1765
Query 1925 AGAATCCAAACAATCACACCCTCCAGTACTGGAAGGACCACAACATCGTGACAGCAGAAGTCCACTGGGCTAAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 AGAATCCAAACAATCACACCCTCCAGTACTGGAAGGACCACAACATCGTGACAGCAGAAGTCCACTGGGCTAAC 1839
Query 1999 CTGACTGTCAGTGTAAGTC---------------------TGGGAGCTG------------------------- 2026
|||||||||||||.|.|.| |||||.|||
Sbjct 1840 CTGACTGTCAGTGAATGCCAGGAGATGCATGGAGAGTTCATGGGATCTGCGTGCGGCCATCATGGACCCTACAC 1913
Query 2027 -CCAGATGTCC----------------TAGCATTGTGACCAC-------------------------AGGTTTA 2058
||.||||||| |..|.||.|.||||| |.|||||
Sbjct 1914 TCCTGATGTCCTCTTTTGGTCCTGTATTCTCTTTTTCACCACCTTCATCCTCTCAAGCACCTTAAAGACGTTTA 1987
Query 2059 GGAGGGACTTCTAAG----------------------------------------------------------- 2073
.||.| ||
Sbjct 1988 AGACG--------AGCCGTTATTTCCCAACCAGAGTACGCTCCATGGTGAGTGACTTTGCTGTTTTCCTCACTA 2053
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2054 TCTTCACAATGGTGATTATTGATTTTTTGATTGGAGTCCCATCACCAAAGCTTCAAGTTCCCAGTGTGTTCAAG 2127
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2128 CCAACAAGGGATGATCGCGGATGGATTATTAATCCCATTGGCCCCAATCCCTGGTGGACTGTGATAGCTGCAAT 2201
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2202 TATCCCAGCTCTTCTCTGTACTATCTTGATATTCATGGATCAGCAGATCACAGCCGTCATTATTAACAGGAAGG 2275
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2276 AACATAAGCTCAAGAAAGGCTGTGGCTACCACCTGGACCTACTGATGGTGGCCATCATGCTGGGTGTCTGCTCC 2349
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2350 ATCATGGGCCTGCCCTGGTTTGTAGCTGCAACTGTCTTGTCCATCACACATGTGAACAGCCTCAAGCTAGAATC 2423
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2424 TGAATGCTCTGCTCCTGGAGAACAGCCCAAGTTCCTGGGCATCCGAGAACAGAGAGTGACAGGCCTTATGATCT 2497
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2498 TTGTGCTGATGGGCTGCTCAGTCTTCATGACGGCTATCTTAAAGTTTATTCCAATGCCAGTACTCTACGGAGTT 2571
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2572 TTCCTTTACATGGGAGTTTCTTCACTACAGGGAATTCAGTCTCAGTTTCCATTTCTGTCCAGAGGAAATGGTGT 2645
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2646 TACCTACCTTTCAGAGCAGTTCTTTGATCGTCTAAAGCTCTTTGGGATGCCCGCAAAGCACCAGCCAGATTTCA 2719
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2720 TCTACCTGCGGCATGTGCCGCTGCGCAAAGTGCACCTCTTCACCCTCATCCAGTTGACCTGTCTCGTCCTGCTC 2793
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2794 TGGGTCATCAAGGCATCTCCAGCTGCCATTGTTTTCCCAATGATGGTTTTGGCCTTGGTCTTTGTCAGGAAAGT 2867
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2868 CATGGATCTCTGTTTCTCTAAGCGAGAGCTGAGCTGGCTAGATGATCTCATGCCTGAAAGCAAAAAGAAGAAGT 2941
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 2942 TGGATGATGCCAAAAAGAAGGCCAAGGAGGAAGAGGAGGCTGAGAAAATGTTAGAAATTGGGGGAGACAAGTTT 3015
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 3016 CCCTTAGAGAGCAGGAAGTTACTAAGTAGTCCTGGAAAGAACATCAGTTGCAGATGTGACCCCTCTGAGATTAA 3089
Query 2074 -------------------------------------------------------------------------- 2073
Sbjct 3090 TATATCTGATGAAATGCCTAAAACTACAGTTTGGAAAGCTCTCAGTATGAATTCTGGAAATGCAAAGGAAAAGA 3163
Query 2074 ----------- 2073
Sbjct 3164 GTCTCTTCAAC 3174
