Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11428
• Subject: NM_001256717.1
• Aligned Length: 851
• Identities: 553
• Gaps: 291

Alignment

Query   1  MSGRTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74
                                             |...|.. ..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------------MRAFKNN-NNLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  39

Query  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  40  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  113

Query 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  187

Query 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAE--------------APSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  282
           |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNKSGA  261

Query 283  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPPPP  356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262  PSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPPPP  335

Query 357  AGGATAWG------------------------------------------------------------------  364
           ||||||||                                                                  
Sbjct 336  AGGATAWGDLLGEDSLAALSSVPSEAQISDPFAPEPTPPTTTAEIATASASASTTTTVTAVTAEVDLFGDAFAA  409

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 410  SPGEAPAASEGAAAPATPTPVAAALDACSGNDPFAPSEGSAEAAPELDLFAMKPPETSVPVVTPTASTAPPVPA  483

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 484  TAPSPAPAVAAAAAATTAATAAATTTTTTSAATATTAPPALDIFGDAFSSPPQGASPVPESSLTADLLSDAFGS  557

Query 365  -----------------------GFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPNFEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLG  415
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558  SASEPQPASQAASSSSASADLLAGFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPNFEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLG  631

Query 416  DLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQ  489
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632  DLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQ  705

Query 490  PKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPPAGTGMPMMPQQPVMFAQPMMRPPFGA  563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706  PKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPPAGTGMPMMPQQPVMFAQPMMRPPFGA  779

Query 564  AAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLN-----  595
           ||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 780  AAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLNIKDFL  816