Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11428
Subject:
NM_001357772.1
Aligned Length:
871
Identities:
559
Gaps:
287

Alignment

Query   1  MSGRTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGQTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74

Query  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148

Query 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KKGADGVMRTMVPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222

Query 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAE--------------APSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNK--S  280
           |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||.  |
Sbjct 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNNEGS  296

Query 281  GAPSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPP  354
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||||||||| ||.||.||||. .
Sbjct 297  GAPSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDIFATASAAAPVSSAKPSSDLLDLQPDF-SGAAAGAAAPV-V  368

Query 355  PPAGGATAWG----------------------------------------------------------------  364
           ||.|||||||                                                                
Sbjct 369  PPSGGATAWGDLLGEDSLAALSSVPCEAPISDPFAPEPSPPTTTTEPASASASTTTAVTAVTTEVDLFGDPFAP  442

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 443  SEGSAEAAPELDLFAMKPPETSAPVVTPTASTAPPVPATAPSPAPTAVAATAATTTAAAAATTTATTSAAAATT  516

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 517  AAAPPALDIFGDLFDSAPEVAAAPKPDAAPSIDLFGTDAFSSPPRGASPVPESSLTADLLSVDAFAAPSPASTA  590

Query 365  -------------------------------------------GFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPNFEAAFG  395
                                                      ||||||||||..||||||||||||.||||||
Sbjct 591  SPAKAESSGVIDLFGDAFGSGASETQPAPQAVSSSSASADLLAGFGGSFMAPSTTPVTPAQNNLLQPSFEAAFG  664

Query 396  TTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPAGQPAPVSMVPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTK  469
           ||||||||||||||     ||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 665  TTPSTSSSSSFDPS-----GDLLMPTMAPSGQPAPVSMVPPSPAMAASKGLGSDLDSSLASLVGNLGISGTTSK  733

Query 470  KGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVAPATWSAGVPPSAPLQGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPPAGTGMP  543
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||    ||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||.
Sbjct 734  KGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVTPATWSAGVPP----QGTVPPTSSVPPGAGAPSVGQPGAGFGMPPSGTGMT  803

Query 544  MMPQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPASQSPKKPPAKDPLADLN-----  595
           ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||     
Sbjct 804  MMSQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPATQSPKKPPAKDPLADLNIKDFL  860