Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11428
- Subject:
- XM_030244157.1
- Aligned Length:
- 2614
- Identities:
- 1602
- Gaps:
- 845
Alignment
Query 1 ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
Query 75 GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
Query 149 ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT 222
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG 222
Query 223 GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC 296
||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC 296
Query 297 TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA 370
Query 371 TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG 444
||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG 444
Query 445 AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG 518
Query 519 ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA 592
.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA 592
Query 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT 666
Query 667 TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT 740
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 667 TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT 740
Query 741 GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA 772
|||||||||.||||||||.| ||.|||||||||
Sbjct 741 GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA 814
Query 773 GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 846
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 888
Query 847 CCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATTGA 920
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATCGA 962
Query 921 CACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCATCTAGTG 994
|||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.|||||.||.|
Sbjct 963 CACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCATCAAGCG 1036
Query 995 ATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------------ 1041
|||||||.||.||.|||||.||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1037 ATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCTCCTTCT 1107
Query 1042 ------------------------------GCCGCA-------------------------------------- 1047
||.|||
Sbjct 1108 GGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTGTGAAGCACCGATTTCAGACCC 1181
Query 1048 ----GCACCAG----------------------------------------------------CACCAC----- 1060
||||||| ||||||
Sbjct 1182 ATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCTCTGCCTCGACCACCACAGCTG 1255
Query 1061 -------------------------------------------------------------------------- 1060
Sbjct 1256 TGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCTCCTGGGGAGGCCCCTGCAGCA 1329
Query 1061 ----------------CACCACCT-------------------------------------------------- 1068
|||||.||
Sbjct 1330 TCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGATGCATGCTCAGGAAATGACCC 1403
Query 1069 ---------------------------------------GCTGGA----------------------------- 1074
||||||
Sbjct 1404 TTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTGCAATGAAGCCACCTGAGACCA 1477
Query 1075 -------------------------------------------------------------------------- 1074
Sbjct 1478 GCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACTGCTCCTTCTCCTGCTCCCACG 1551
Query 1075 ------GGAGCCACTGC--------------------------------------------------------- 1085
|.|||||||||
Sbjct 1552 GCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCACTGCCACCACCTCTGCTGCTGC 1625
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1626 TGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTGATTCTGCTCCTGAAGTTGCTG 1699
Query 1086 ------------------------------------------------ATG----------------------- 1088
|||
Sbjct 1700 CAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCTTTCTCCTCCCCGCCACGAGGG 1773
Query 1089 -------------------------------------------------------------------------- 1088
Sbjct 1774 GCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGTGGACGCATTTGCAGCGCCGTCTCCTGC 1847
Query 1089 ----------------------------------------------------GGGAGGATTTGGGGGTTCTTTC 1110
||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1848 ATCCACTGCCTCTCCTGCAAAGGCGGAGTCCTCGGGTGTCATAGACCTTTTTGGG-GGATTTGGGGGTTCTTTC 1920
Query 1111 ATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGCAGCTTTTGG 1184
|||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1921 ATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGCAGCTTTTGG 1994
Query 1185 GACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATCTTTTGATGC 1258
.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||
Sbjct 1995 AACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATCTTCTGATGC 2068
Query 1259 CAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAA 1332
||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 CAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAA 2142
Query 1333 GCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTACCACAACAAA 1406
|.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 2143 GGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTACCACATCAAA 2216
Query 1407 AAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTAAAGTAGCTC 1480
||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||..|||
Sbjct 2217 AAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGAAAGTCACTC 2290
Query 1481 CAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGTTCAGTTCCT 1554
||||.||.||||||||.||.|||||.|| ||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2291 CAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGCTCAGTCCCT 2352
Query 1555 CCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGACAGGCATGCC 1628
||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|
Sbjct 2353 CCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGACAGGCATGAC 2426
Query 1629 CATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCGCTGTACCTG 1702
|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2427 CATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAGCTGTGCCCG 2500
Query 1703 GCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGACCCATTAGCG 1776
||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2501 GCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGACCCGTTAGCG 2574
Query 1777 GATCTTAAC--------------- 1785
|||||||||
Sbjct 2575 GATCTTAACATCAAGGATTTCTTG 2598