Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11432
- Subject:
- XM_006507240.2
- Aligned Length:
- 2177
- Identities:
- 1843
- Gaps:
- 103
Alignment
Query 1 ATGGCAACCCCGGCGGCGGTCAACCCTCCGGAAATGGCTTCAGACATACCTGGATCTGTGACGTTGCCCGTTGC 74
|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGGCGTCAGACATACCAGGATCTGTGGCCTTGCCTGTTGC 41
Query 75 CCCCATGGCGGCCACCGGACAGGTGAGGATGGCGGGGGCCATGCCTGCCCGTGGAGGAAAGCGGCGTTCCGGAA 148
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 42 CCCCATGGCAGCCACCGGACAGGTGAGAATGGCAGGGGCCATGCCTGCCCGAGGAGGAAAGCGTCGATCCGGAA 115
Query 149 TGGACTTCGATGATGAAGATGGTGAAGGCCCCAGTAAATTTTCAAGAGAGAATCATAGTGAAATCGAAAGGCGC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||..|||||
Sbjct 116 TGGACTTCGATGACGAAGATGGTGAAGGTCCCAGTAAATTCTCAAGAGAGAACCACAGTGAGATTGAGCGGCGC 189
Query 223 AGACGGAACAAGATGACTCAGTACATCACGGAGCTCTCCGACATGGTCCCCACATGCAGCGCACTGGCTCGGAA 296
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct 190 AGGCGGAACAAGATGACTCAATATATTACGGAACTCTCCGACATGGTTCCCACCTGCAGTGCACTGGCTAGGAA 263
Query 297 GCCAGACAAGCTCACCATCCTCCGCATGGCCGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGTACAGGGAACAAGTCCA 370
||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 264 GCCAGACAAGCTGACCATCCTGCGCATGGCGGTCTCGCACATGAAGTCCATGAGGGGCACCGGCAACAAATCGA 337
Query 371 CCGATGGCGCGTACAAGCCTTCCTTCCTCACAGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTTGAAGCAGCTGATGGA 444
|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 338 CTGACGGCGCCTACAAGCCTTCCTTCCTCACTGAGCAGGAACTGAAGCATCTCATCCTGGAAGCCGCTGATGGA 411
Query 445 TTTCTGTTTGTGGTGGCTGCTGAGACAGGGCGAGTGATTTATGTGTCTGACTCCGTCACCCCTGTTCTGAACCA 518
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 412 TTTCTGTTTGTGGTGGCAGCTGAGACAGGGAGAGTCATCTACGTGTCTGATTCGGTCACTCCTGTCCTGAACCA 485
Query 519 GCCCCAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACACTGTATGAACAGGTGCATCCTGATGACGTGGAGAAGCTGAGAGAGC 592
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 486 GCCACAGTCAGAGTGGTTTGGGAGCACGCTTTATGAGCAGGTGCACCCTGATGACGTGGAGAAACTGAGGGAAC 559
Query 593 AACTGTGCACCTCAGAAAACTCAATGACAGGCCGGATCTTGGACCTGAAGACTGGGACGGTCAAGAAAGAAGGG 666
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 560 AGCTGTGCACTTCGGAAAACTCCATGACAGGCCGCATCCTGGACCTGAAGACTGGGACAGTGAAGAAGGAGGGA 633
Query 667 CAGCAGTCATCCATGAGGATGTGCATGGGCTCGCGGCGGTCTTTCATCTGCAGGATGAGGTGTGGAAATGCTCC 740
|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 634 CAGCAGTCATCCATGCGCATGTGTATGGGCTCTCGGCGCTCCTTCATCTGTAGGATGAGGTGTGGAAACGCTCC 707
Query 741 TTTGGACCACCTTCCTCTAAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 814
.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 CTTGGACCACCTGCCTTTGAACAGAATAACCACCATGAGGAAAAGGTTCAGGAATGGCCTTGGCCCTGTGAAAG 781
Query 815 AAGGAGAAGCCCAATATGCTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGGCCTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 888
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 AAGGAGAAGCCCAGTATGCTGTGGTCCACTGCACAGGTTACATCAAGGCTTGGCCACCAGCAGGAATGACCATA 855
Query 889 CCTGAAGAAGACGCTGATGTGGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGACTCCAGGTGACCAG 962
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 856 CCCGAAGAAGACGCTGATGTCGGACAAGGCAGTAAATATTGCCTCGTGGCAATTGGGAGGCTCCAGGTGACCAG 929
Query 963 CTCTCCTGTATGCATGGACATGAATGGGATGTCGGTGCCCACAGAGTTCTTATCCCGGCATAACTCCGATGGAA 1036
|||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 930 CTCTCCTGTGTGCATGGACATGAGCGGCATGTCAGTGCCCACAGAGTTCCTGTCACGGCACAACTCTGATGGGA 1003
Query 1037 TCATCACATTTGTGGATCCAAGATGTATCAGTGTGATTGGCTACCAACCGCAGGATCTTCTGGGAAAGGACATT 1110
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1004 TTATCACGTTTGTGGACCCCAGATGCATCAGTGTGATTGGCTACCAGCCCCAGGACCTTCTGGGAAAGGATATT 1077
Query 1111 TTGGAATTCTGCCACCCTGAGGATCAAAGCCATCTGCGTGAGAGCTTCCAGCAGGTGGTTAAGCTGAAAGGCCA 1184
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1078 TTGGAATTTTGCCACCCTGAGGATCAGAGCCACCTACGGGAGAGCTTCCAACAGGTGGTTAAGCTGAAGGGCCA 1151
Query 1185 AGTCCTGTCGGTCATGTATCGATTTCGCACCAAGAACCGGGAGTGGATGTTGATCCGCACCAGCAGCTTCACAT 1258
|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1152 AGTGCTGTCGGTCATGTATCGGTTCCGCACCAAGAACCGGGAGTGGCTGTTGATCCGTACCAGCAGCTTCACCT 1225
Query 1259 TCCAGAATCCCTATTCTGATGAGATTGAGTACATCATCTGCACCAACACCAACGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1332
|||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 TCCAGAACCCCTACTCTGATGAGATCGAGTACGTCATCTGCACCAACACCAATGTCAAGCAACTTCAGCAACAG 1299
Query 1333 CAGGCAGAATTGGAAGTGCACCAGAGAGATGGATTGTCATCGTATGACTTATCCCAGGTCCCCGTCCCCAACCT 1406
|||||||||.||||.||.||.|||.|||||||..||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1300 CAGGCAGAACTGGAGGTACATCAGCGAGATGGGCTGTCGTCATATGACTTATCTCAGGTCCCAGTACCCAACCT 1373
Query 1407 ACCAGCCGGTGTTCATGAGGCCGGGAAGTCCGTGGAAAAGGCGGATGCAATCTTCTCCCAGGAAAGAGATCCTC 1480
|||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1374 ACCCGCTGGTGTTCACGAGGCCGGGAAGTCTGTGGAAAAGGCAGATGCAATCTTCTCCCAAGAGAGAGACCCTC 1447
Query 1481 GGTTTGCTGAAATGTTTGCAGGAATTAGTGCATCGGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCTGCAGCAGGAACC 1554
|.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.|
Sbjct 1448 GTTTTGCTGAGATGTTTGCAGGCATCAGTGCATCTGAGAAGAAGATGATGAGCTCAGCCTCAGCATCAGGCAGC 1521
Query 1555 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGCCCATTTCCCT-CTGGACACTCCGGGAAGGCCTTCAGCTCTTCAGTGGTTC 1627
|||||||||||||||||||||||.||| |||||| |.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1522 CAGCAGATCTACTCCCAAGGAAGTCCA-TTCCCTGCCGGGCACTCGGGCAAGGCCTTCAGCTCTTCCGTGGTCC 1594
Query 1628 ATGTGCCTGGAGTGAATGATATTCAGTCCTCTTCTTCCACGGGCCAGAACATGTCCCAAATCTCCCGGCAGCTA 1701
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1595 ATGTGCCTGGAGTGAATGACATTCAGTCCTCCTCCTCAACGGGACAGAACATATCCCAGATCTCTCGGCAGCTG 1668
Query 1702 AACCAGAGTCAGGTGGCATGGACAGGGAGTCGTCCGCCCTTTCCGGGACAGCAAATCCCATCTCAGTCCAGCAA 1775
||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||| |||||||
Sbjct 1669 AACCAGGGCCAGGTGGCATGGACAGGCAGCCGTCCACCGTTCCCAGGGCAGC---------------CCAGCAA 1727
Query 1776 GACTCAGTCATCTCCCTTTGGGATTGGAACGAGCCACACCTACCCGGCAGACCCCTCTTCCTACAGCCCCCTCT 1849
|||.|||||||||.||||.||.||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1728 GACGCAGTCATCTGCCTTCGGAATTGGATCAAGCCACCCTTACCCGGCTGACCCTTCATCCTACAGTCCTCTCT 1801
Query 1850 CCAGCCCAGCTACCTCCTCGCCAAGTGGGAATGCCTACTCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTCGCTGAA 1923
|||||||||||.|||||||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1802 CCAGCCCAGCTGCCTCCTCACCAAGTGGAAACGCATACCCCAGTCTTGCCAACAGGACTCCAGGGTTTGCTGAG 1875
Query 1924 AGTGGACAAAGTAGCGGGCAGTTCCAAGGGCGGCCCTCGGAAGTCTGGTCGCAGTGGCAAAGCCAGCACCATGG 1997
||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1876 AGTGGACAGAGTGGCGGGCAGTTCCAGGGCCGGCCCTCGGAGGTCTGGTCCCAGTGGCAGAGCCAGCATCACGG 1949
Query 1998 CCAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCCCACCAGCAGCCCGGTCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTGCCCATGC 2071
.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1950 ACAGCAGAGCGGTGAGCAGCACTCGCATCAGCAGCCTGGCCAGACTGAAGTGTTCCAGGACATGCTACCCATGC 2023
Query 2072 CAGGAGATC-----CAGGGAATGAATGGTGGTCTCCCCACT-----CCCGGCAGCACTTTAGGCAGCCCATAAG 2135
|.||.||.| ||||| ||.||| |.||| ..|| ||.||||| ||.|.||
Sbjct 2024 CGGGCGACCCGACGCAGGG---GACTGG--------CAACTATAACATCG--AGGACTTT--GCTGACC----- 2077
Query 2136 CTATGCGAGAATG------------------ 2148
.|.|.|||
Sbjct 2078 -----TGGGCATGTTCCCTCCATTTTCTGAG 2103