Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11444
- Subject:
- XM_017017046.2
- Aligned Length:
- 1299
- Identities:
- 926
- Gaps:
- 363
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTTTTCAAGATTGCAGATGCCGCCTACAGAGACGACAGTCATATTTGAGCCCCGAAGCTCGCGAATGTAG 74
Query 1 -------------------------------ATGGCGGAATCCAGGGGCCGTCTGTACCTTTGGATGTGCTTGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGCGCCCCAAGCTCGGTCCTCAAGAAGCCATGGCGGAATCCAGGGGCCGTCTGTACCTTTGGATGTGCTTGG 148
Query 44 CTGCTGCGCTGGCATCTTTCCTGATGGGATTTATGGTGGGCTGGTTTATTAAGCCTCTCAAAGAAACAACCACT 117
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CTGCTGCGCTGGCATCTTTCCTGATGGGATTTATGGTGGGCTGGTTTATTAAGCCTCTCAAAGAAACGACCACT 222
Query 118 TCTGTGCGCTATCATCAAAGTATACGGTGGAAACTGGTATCCGAAATGAAAGCTGAAAACATCAAATCATTTCT 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGTGCGCTATCATCAAAGTATACGGTGGAAACTGGTATCCGAAATGAAAGCTGAAAACATCAAATCATTTCT 296
Query 192 TCGTTCTTTTACAAAGCTTCCTCATCTGGCAGGAACAGAACAAAATTTCTTGCTTGCCAAGAAAATCCAAACCC 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCGTTCTTTTACAAAGCTTCCTCATCTGGCAGGAACAGAACAAAATTTCTTGCTTGCCAAGAAAATCCAAACCC 370
Query 266 AGTGGAAGAAATTTGGACTAGATTCAGCCAAGTTGGTTCATTATGATGTCCTCTTATCTTACCCCAATGAGACA 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTGGAAGAAATTTGGACTAGATTCAGCCAAGTTGGTTCATTATGATGTCCTCTTATCTTACCCCAATGAGACA 444
Query 340 AATGCCAACTATATATCGATTGTGGATGAACATGAAACTGAGATTTTCAAAACATCATACCTTGAACCACCACC 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGCCAACTATATATCGATTGTGGATGAACATGAAACTGAGATTTTCAAAACATCATACCTTGAACCACCACC 518
Query 414 AGATGGCTATGAGAATGTTACAAATATTGTGCCACCATATAATGCTTTCTCAGCCCAAGGCATGCCAGAGGGAG 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGATGGCTATGAGAATGTTACAAATATTGTGCCACCATATAATGCTTTCTCAGCCCAAGGCATGCCAGAGGGAG 592
Query 488 ATCTTGTATATGTGAACTATGCTCGCACTGAAGACTTTTTCAAACTAGAAAGAGAGATGGGCATCAACTGTACT 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCTTGTATATGTGAACTATGCTCGCACTGAAGACTTTTTCAAACTAGAAAGAGAGATGGGCATCAACTGTACT 666
Query 562 GGGAAGATTGTTATTGCAAGATATGGAAAAATCTTCAGAGGAAATAAAGTTAAAAATGCCATGTTAGCAGGAGC 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGAAGATTGTTATTGCAAGATATGGAAAAATCTTCAGAGGAAATAAAGTTAAAAATGCCATGTTAGCAGGAGC 740
Query 636 CATAGGAATCATCTTGTACTCAGATCCAGCTGACTACTTTGCTCCTGAGGTACAGCCATATCCCAAAGGATGGA 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATAGGAATCATCTTGTACTCAGATCCAGCTGACTACTTTGCTCCTGAGGTACAGCCATATCCCAAAGGATGGA 814
Query 710 ATCTTCCTGGAACTGCAGCCCAGAGAGGAAATGTGTTAAATTTGAATGGTGCTGGTGACCCACTCACTCCAGGC 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCTTCCTGGAACTGCAGCCCAGAGAGGAAATGTGTTAAATTTGAATGGTGCTGGTGACCCACTCACTCCAGGC 888
Query 784 TATCCAGCAAAAGAATACACTTTCAGACTTGATGTTGAAGAAGGAGTGGGAATCCCCCGAATACCTGTACATCC 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATCCAGCAAAAGAATACACTTTCAGACTTGATGTTGAAGAAGGAGTGGGAATCCCCCGAATACCTGTACATCC 962
Query 858 CATTGGATATAATGATGCAGAAATATTATTACGGTATAGTTTTCTTG-------TTG--------GATATGAGA 916
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|| |||| ||| ||||.|||.
Sbjct 963 CATTGGATATAATGATGCAGAAATATTATTACGCTA-------CTTGGGAGGAATTGCTCCACCAGATAAGAGT 1029
Query 917 T------------------TAAGATATTTTGCACTAGT--------TGTCT------------ATTTTCTCAT- 951
| |.||.|| |||| ||.|| |||.|.|||.
Sbjct 1030 TGGAAGGGAGCCCTTAATGTGAGTTA--------TAGTATCGGACCTGGCTTTACAGGGAGTGATTCTTTCAGG 1095
Query 952 -------------------------------------------------------------------------- 951
Sbjct 1096 AAGGTTAGAATGCATGTTTATAACATCAATAAAATTACAAGGATTTACAATGTAGTTGGAACTATCAGAGGATC 1169
Query 952 -------------------------------------------------------------------------- 951
Sbjct 1170 TGTGGAACCTGGTATGTTATTCTGGGAGGTCACCGGGACTCCTGGGTATTTGGAGCTATTGACCCAACCAGTGG 1243
Query 952 ----------------------------------------- 951
Sbjct 1244 GGTTGCTGTTTTGCAAGAAATTGCCCGGAGTTTTGGAAAAC 1284