Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11450
Subject:
NM_001286121.1
Aligned Length:
1329
Identities:
1327
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCCAATGCCTCCACAGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCCAATGCTTCCACAGA  74

Query   75  ACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAATGGCCCCTGCATATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAATGGCCCCTGCATATG  148

Query  149  ACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGGCTCCAATCCCCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGGCTCCAATCCCCAGT  222

Query  223  GGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCCTCATTCCTGACCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCCTCATTCCTGACCCT  296

Query  297  CTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACAAGGCATAGCCCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACAAGGCATAGCCCAGG  370

Query  371  TTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGAGTCAACTCACCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGAGTCAACTCACCACC  444

Query  445  ATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTCTGCCAGACCATAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTCTGCCAGACCATAGG  518

Query  519  ATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTTTCCTCTCATTTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTTTCCTCTCATTTATG  592

Query  593  ATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCATTGGCTCAGCAGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCATTGGCTCAGCAGGAC  666

Query  667  TGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCCATTTTAGTCTCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCCATTTTAGTCTCTTA  740

Query  741  TTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTCGGTACTTCAAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTCGGTACTTCAAGCCA  814

Query  815  ACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTATCCTTGGAGGTCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTATCCTTGGAGGTCTA  888

Query  889  CTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTCACTACCATTGGGGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  889  CTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTCACTGCCATTGGGGT  962

Query  963  TCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGACCATGACCTTCTTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGACCATGACCTTCTTGG  1036

Query 1037  TGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATATTGCTCCTCGGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATATTGCTCCTCGGTAC  1110

Query 1111  ACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCTACTGCTGCTGGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCTACTGCTGCTGGATT  1184

Query 1185  TTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGTTAACATATCGGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGTTAACATATCGGGCC  1258

Query 1259  TGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACATTCACCCACCTC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACATTCACCCACCTC  1329