Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11450
• Subject: XM_011514213.2
• Aligned Length: 1491
• Identities: 1093
• Gaps: 396

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTACCGGACCAGATGTCAAGGCTACAGTGGGGGACATTTCCAGTGATGGCAATTTAAACGTGGCTCAAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATGCTCCAGGAAAGGTTTTTGTTCAGTCCGACATGGGCTGGCCCTCATCTTGCAGCTCTGTAATTTTTCAA  148

Query    1  --------------ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTACACCCAACAAATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  222

Query   61  AATGCCTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  134
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGCTTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  296

Query  135  GGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGG  208
                                                                                      
Sbjct  297  --------------------------------------------------------------------------  296

Query  209  CTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC  282
                                                                                      
Sbjct  297  --------------------------------------------------------------------------  296

Query  283  TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACA  356
                                                                                      
Sbjct  297  --------------------------------------------------------------------------  296

Query  357  AGGCATAGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  430
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ------------GGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  358

Query  431  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  432

Query  505  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  506

Query  579  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  580

Query  653  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  654

Query  727  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  728

Query  801  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTA  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTA  802

Query  875  TCCTTGGAGGTCTACTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  TCCTTGGAGGTCTACTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTC  876

Query  949  ACTACCATTGGGGTTCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGAC  1022
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  ACTGCCATTGGGGTTCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGAC  950

Query 1023  CATGACCTTCTTGGTGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CATGACCTTCTTGGTGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATA  1024

Query 1097  TTGCTCCTCGGTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  TTGCTCCTCGGTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCT  1098

Query 1171  ACTGCTGCTGGATTTTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  ACTGCTGCTGGATTTTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGT  1172

Query 1245  TAACATATCGGGCCTGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACAT  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  TAACATATCGGGCCTGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACAT  1246

Query 1319  TCACCCACCTC  1329
            |||||||||||
Sbjct 1247  TCACCCACCTC  1257