Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11450
• Subject: XM_011514218.2
• Aligned Length: 1329
• Identities: 866
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCCAATGCCTCCACAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAATGGCCCCTGCATATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGGCTCCAATCCCCAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCCTCATTCCTGACCCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACAAGGCATAGCCCAGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGAGTCAACTCACCACC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTCTGCCAGACCATAGG  518
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------ATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTCTGCCAGACCATAGG  56

Query  519  ATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTTTCCTCTCATTTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  ATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTTTCCTCTCATTTATG  130

Query  593  ATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCATTGGCTCAGCAGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  ATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCATTGGCTCAGCAGGAC  204

Query  667  TGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCCATTTTAGTCTCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  TGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCCATTTTAGTCTCTTA  278

Query  741  TTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTCGGTACTTCAAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  TTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTCGGTACTTCAAGCCA  352

Query  815  ACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTATCCTTGGAGGTCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  ACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTATCCTTGGAGGTCTA  426

Query  889  CTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTCACTACCATTGGGGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  427  CTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTCACTGCCATTGGGGT  500

Query  963  TCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGACCATGACCTTCTTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGACCATGACCTTCTTGG  574

Query 1037  TGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATATTGCTCCTCGGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  TGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATATTGCTCCTCGGTAC  648

Query 1111  ACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCTACTGCTGCTGGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  ACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCTACTGCTGCTGGATT  722

Query 1185  TTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGTTAACATATCGGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGTTAACATATCGGGCC  796

Query 1259  TGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACATTCACCCACCTC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  TGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACATTCACCCACCTC  867