Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11450
• Subject: XM_017010150.1
• Aligned Length: 1491
• Identities: 1000
• Gaps: 489

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTACCGGACCAGATGTCAAGGCTACAGTGGGGGACATTTCCAGTGATGGCAATTTAAACGTGGCTCAAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATGCTCCAGGAAAGGTTTTTGTTCAGTCCGACATGGGCTGGCCCTCATCTTGCAGCTCTGTAATTTTTCAA  148

Query    1  --------------ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTACACCCAACAAATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  222

Query   61  AATGCCTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  134
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGCTTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  296

Query  135  GGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGG  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGG  370

Query  209  CTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC  444

Query  283  TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACA  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACA  518

Query  357  AGGCATAGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCATAGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  592

Query  431  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  666

Query  505  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  740

Query  579  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  814

Query  653  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  888

Query  727  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  962

Query  801  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTA  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTA  1036

Query  875  TCCTTGGAGGTCTACTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTTGGAGGTCTACTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTC  1110

Query  949  ACTACCATTGGGGTTCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGAC  1022
            |||.|||||                                                                 
Sbjct 1111  ACTGCCATT-----------------------------------------------------------------  1119

Query 1023  CATGACCTTCTTGGTGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATA  1096
                                                                                      
Sbjct 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119

Query 1097  TTGCTCCTCGGTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCT  1170
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 1120  ---------GGTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACA--------------------  1164

Query 1171  ACTGCTGCTGGATTTTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGT  1244
                                                                                      
Sbjct 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164

Query 1245  TAACATATCGGGCCTGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACAT  1318
                                                                                      
Sbjct 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164

Query 1319  TCACCCACCTC  1329
                       
Sbjct 1165  -----------  1164