Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11482
• Subject: XM_011515060.2
• Aligned Length: 1647
• Identities: 1431
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAA  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCCCTGCCTGGATAACCTGAGGACCATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAA  74

Query   45  GGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCA  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCA  148

Query  119  CCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGACAGAGTCGTGG--------------------------------  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  149  CCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGACAGAGTCGTGGTTACATATGGGGCTGATGACTTTAGGGATTTC  222

Query  161  ----------------------------CCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCG  206
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCG  296

Query  207  TGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATG  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATG  370

Query  281  GCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAG  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAG  444

Query  355  TGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACG  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACG  518

Query  429  GCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATT  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATT  592

Query  503  CCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTG  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTG  666

Query  577  AGGACGCACTCC--------------------------------------------------------------  588
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  667  AGGACGCACTCCGTTGGTAAACCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGAAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGA  740

Query  589  ----------------------------------------------------------------GTCATTAAAG  598
                                                                            ||||||||||
Sbjct  741  GGAACATAAAGAGCGCTGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCACACTGTACCCAGTCATTAAAG  814

Query  599  AAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGA  888

Query  673  CTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACAC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACAC  962

Query  747  GCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCA  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCA  1036

Query  821  ACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTG  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTG  1110

Query  895  GTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGC  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGC  1184

Query  969  CCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCC  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCC  1258

Query 1043  CGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTG  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTG  1332

Query 1117  ACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCG  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCG  1406

Query 1191  CGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGT  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGT  1480

Query 1265  GCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGAT  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGAT  1554

Query 1339  CCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGA  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGA  1628

Query 1413  GCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCACCGCTTCCACATGAGC  1647