Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11482
• Subject: XM_011515076.2
• Aligned Length: 1557
• Identities: 1170
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct  149  ACAGAGTCGTG---------------------------------------------------------------  159

Query  223  GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296
                                                                                      
Sbjct  160  --------------------------------------------------------------------------  159

Query  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370
                                                                                      
Sbjct  160  --------------------------------------------------------------------------  159

Query  371  TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  444
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  --------------------------------------------------GGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  183

Query  445  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  257

Query  519  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC----  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  258  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTG  331

Query  589  --------------------------------------------------------------------------  588
                                                                                      
Sbjct  332  GTAAACCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGAAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAACATAAAGAGCGC  405

Query  589  ------------------------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAG  614
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  TGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCACACTGTACCCAGTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAG  479

Query  615  TGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCG  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  TGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCG  553

Query  689  CCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  CCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGC  627

Query  763  GCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTA  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  GCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTA  701

Query  837  CCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCC  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  CCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCC  775

Query  911  CGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  CGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTG  849

Query  985  GAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  GAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCA  923

Query 1059  AGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCC  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  AGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCC  997

Query 1133  CGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAAC  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  CGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAAC  1071

Query 1207  TCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGT  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  TCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGT  1145

Query 1281  GCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACA  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146  GCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACA  1219

Query 1355  TGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATG  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  TGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATG  1293

Query 1429  AGC  1431
            |||
Sbjct 1294  AGC  1296