Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11497
Subject:
NM_001286277.2
Aligned Length:
907
Identities:
806
Gaps:
93

Alignment

Query   1  MATPDQKSPNVLLQNLCCRILGRSEADVAQQFQYAVRVIGSNFAPTVERDEFLVAEKIKKELIRQRREADAALF  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MATPDQKSPNVLLQNLCCRILGRSEADVAQQFQYAVRVIGSNFAPTVERDEFLVAEKIKKELIRQRREADAALF  74

Query  75  SELHRKLHSQGVLKNKWSILYLLLSLSEDPRRQPSKVSSYATLFAQALPRDAHSTPYYYARPQTLPLSYQDRSA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SELHRKLHSQGVLKNKWSILYLLLSLSEDPRRQPSK----------ALPRDAHSTPYYYARPQTLPLSYQDRSA  138

Query 149  QSAQSSGSVGSSGISSIGLCALSGPAPAPQSLLPGQSNQAPGVGDCLRQQLGSRLAWTLTANQPSSQATTSKGV  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139  QSAQSSGSVGSSGISSIGLCALSGPAPAPQSLLPGQSNQAPGVGDCLRQQLGSRLAWTLTANQPSSQATTSKGV  212

Query 223  PSAVSRNMTRSRREGDTGGTMEITEAALVRDILYVFQGIDGKNIKMNNTENCYKVEGKANLSRSLRDTAVRLSE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213  PSAVSRNMTRSRREGDTGGTMEITEAALVRDILYVFQGIDGKNIKMNNTENCYKVEGKANLSRSLRDTAVRLSE  286

Query 297  LGWLHNKIRRYTDQRSLDRSFGLVGQSFCAALHQELREYYRLLSVLHSQLQLEDDQGVNLGLESSLTLRRLLVW  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287  LGWLHNKIRRYTDQRSLDRSFGLVGQSFCAALHQELREYYRLLSVLHSQLQLEDDQGVNLGLESSLTLRRLLVW  360

Query 371  TYDPKIRLKTLAALVDHCQGRKGGELASAVHAYTKTGDPYMRSLVQHILSLVSHPVLSFLYRWIYDGELEDTYH  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361  TYDPKIRLKTLAALVDHCQGRKGGELASAVHAYTKTGDPYMRSLVQHILSLVSHPVLSFLYRWIYDGELEDTYH  434

Query 445  EFFVASDPTVKTDRLWHDKYTLRKSMIPSFMTMDQSRKVLLIGKSINFLHQVCHDQTPTTKMIAVTKSAESPQD  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435  EFFVASDPTVKTDRLWHDKYTLRKSMIPSFMTMDQSRKVLLIGKSINFLHQVCHDQTPTTKMIAVTKSAESPQD  508

Query 519  AADLFTDLENAFQGKIDAAYFETSKYLLDVLNKKYSLLDHMQAMRRYLLLGQGDFIRHLMDLLKPELVRPATTL  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509  AADLFTDLENAFQGKIDAAYFETSKYLLDVLNKKYSLLDHMQAMRRYLLLGQGDFIRHLMDLLKPELVRPATTL  582

Query 593  YQHNLTGILETAVRATNAQFDSPEILRRLDVRLLEVSPGDTGWDVFSLDYHVDGPIATVFTRECMSHYLRVFNF  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583  YQHNLTGILETAVRATNAQFDSPEILRRLDVRLLEVSPGDTGWDVFSLDYHVDGPIATVFTRECMSHYLRVFNF  656

Query 667  LWRAKRMEYILTDIRKGHMCNAKLLRNMPEFSGVLHQCHILASEMVHFIHQMQYYITFEVLECSWDELWNKVQQ  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657  LWRAKRMEYILTDIRKGHMCNAKLLRNMPEFSGVLHQCHILASEMVHFIHQMQYYITFEVLECSWDELWNKVQQ  730

Query 741  AQDLDHIIAAHEVFLDTIISRCLLDSDSRALLNQLRAVFDQIIELQNAQDAIYRAALEELQRRLQFEEKKKQRE  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731  AQDLDHIIAAHEVFLDTIISRCLLDSDSRALLNQLRAVFDQIIELQNAQDAIYRAALEELQRRLQFEEKKKQRE  804

Query 815  IEVEMCLYCV----------------------------------------------------------------  824
           ||........                                                                
Sbjct 805  IEGQWGVTAAEEEEENKRIGEFKESIPKMCSQLRILTHFYQGIVQQFLVLLTTSSDESLRFLSFRLDFNEHYKA  878

Query 825  -------------------  824
                              
Sbjct 879  REPRLRVSLGTRGRRSSHT  897