Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11502
- Subject:
- XM_006531968.3
- Aligned Length:
- 1563
- Identities:
- 1349
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGTCTCTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
Query 75 CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA 148
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct 75 CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA 148
Query 149 AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC 222
|||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 149 AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC 222
Query 223 GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
Query 297 CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC 370
.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC 370
Query 371 AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC 444
|.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC 444
Query 445 CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG 518
||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG 518
Query 519 CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG 592
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 519 CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG 592
Query 593 TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG 666
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 593 TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG 666
Query 667 CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT 740
|||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct 667 CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT 740
Query 741 GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA 811
|||| |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 741 GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA 814
Query 812 TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC 885
||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||..
Sbjct 815 TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGGGCGGATGTCTGCTCAGGAGAAT 888
Query 886 ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA 959
..|||..|||||||.||||||.||||||||||..||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 GTACCTGTCATGAATGGCGTCGCAGGCCCGGACAGCGAGGACTACAACCCCTGGGCTGACCGAAAGGCTGCCCA 962
Query 960 GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 1033
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCCAAATCCCTGTCTCCCCCGCAGTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 1036
Query 1034 AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCAGCC 1107
||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCACTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCAGCT 1110
Query 1108 GGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCTCCT 1181
|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1111 GGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCTGCT 1184
Query 1182 GAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGAGTG 1255
|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185 GAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGAGTG 1258
Query 1256 AGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGGCTG 1329
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||..||
Sbjct 1259 AGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGATTG 1332
Query 1330 CACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCCACC 1403
||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||
Sbjct 1333 CATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCCCCC 1406
Query 1404 CCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACAGTG 1477
.||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1407 TCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACAGCG 1480
Query 1478 TGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAGG--------------- 1536
|||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..|||||||.
Sbjct 1481 TGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAGCGCGGATGTCGAAGTG 1554
Query 1537 --------- 1536
Sbjct 1555 GCCAGATTT 1563