Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11502
• Subject: XM_006531969.3
• Aligned Length: 1605
• Identities: 1245
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGTCTCTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74
            |||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74

Query   75  CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA  148
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct   75  CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA  148

Query  149  AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC  222
            |||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC  222

Query  223  GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA  296
            ||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA  296

Query  297  CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC  370

Query  371  AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC  444
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC  444

Query  445  CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG  518
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG  518

Query  519  CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG  592
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  519  CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG  592

Query  593  TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG  666
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  593  TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG  666

Query  667  CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT  740
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct  667  CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT  740

Query  741  GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA  811
            ||||   |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  741  GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA  814

Query  812  TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC  885
            ||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||                      
Sbjct  815  TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGG----------------------  866

Query  886  ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA  959
                                                                                      
Sbjct  867  --------------------------------------------------------------------------  866

Query  960  GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  1033
                                    ||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  ------------------------GTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  916

Query 1034  AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCAGCC  1107
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct  917  AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCACTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCAGCT  990

Query 1108  GGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCTCCT  1181
            |||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct  991  GGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCTGCT  1064

Query 1182  GAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGAGTG  1255
            |||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1065  GAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGAGTG  1138

Query 1256  AGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGGCTG  1329
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||..||
Sbjct 1139  AGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGATTG  1212

Query 1330  CACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCCACC  1403
            ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||
Sbjct 1213  CATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCCCCC  1286

Query 1404  CCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACAGTG  1477
            .||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1287  TCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACAGCG  1360

Query 1478  TGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAGG---------------  1536
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||||||               
Sbjct 1361  TGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAGGAATCCCTTCGCCAAC  1434

Query 1537  ---------------------------------------------------  1536
                                                               
Sbjct 1435  GTCCATCTGAAACCAACAGTGACCAATGACAGATCAGCCCCTCTGCTCAGC  1485