Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11582
• Subject: NM_001081442.3
• Aligned Length: 1970
• Identities: 1479
• Gaps: 274

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC  219
            ||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.||||  || |.|||.|.|||
Sbjct  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC  219

Query  220  CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG  284
            ||||||||.||  .|.|  ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||       |||.|||.|
Sbjct  220  CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG  284

Query  285  ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT  358
            ||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  285  ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGAT  358

Query  359  TCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGAT  430
            ||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||..|
Sbjct  359  TCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGT  430

Query  431  GTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTG  501
            |||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.||||||||
Sbjct  431  GTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTG  498

Query  502  GACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTG  575
            .||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||
Sbjct  499  TACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTG  572

Query  576  GAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTC  649
            ||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  573  GAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTC  646

Query  650  TGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCC  721
            ||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||  |.|.||  ||||
Sbjct  647  TGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCC  718

Query  722  TGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTC  795
            |||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  719  TGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTC  792

Query  796  CAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  869
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA  866

Query  870  CGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAAC  942
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  867  CGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC  939

Query  943  ATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGG  1013
            ||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  940  ATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGG  1010

Query 1014  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCC  1087
            |||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct 1011  AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCC  1084

Query 1088  ATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGAC  1160
            |||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1085  ATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGAC  1157

Query 1161  CTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTG  1234
            |||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.
Sbjct 1158  CTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTT  1231

Query 1235  AGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACAC  1306
            |.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| ||||||
Sbjct 1232  ACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACAC  1303

Query 1307  C---------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAG  1329
            |                                                   ||||||||||||..||||||.|
Sbjct 1304  CTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGG  1377

Query 1330  GTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCG  1403
            |||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1378  GTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCA  1451

Query 1404  TCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGC  1477
            |||.|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1452  TCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGC  1513

Query 1478  CCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTG  1551
            ||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||||
Sbjct 1514  CCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTG  1587

Query 1552  AAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC  1625
            ||||||||||||.|..|||||.||||||||.|||                                        
Sbjct 1588  AAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGG----------------------------------------  1621

Query 1626  GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC  1699
              ||||.||                                                                 
Sbjct 1622  --ATGCTCC-----------------------------------------------------------------  1628

Query 1700  TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG  1773
                                                             |||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1629  -------------------------------------------------GGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAG  1653

Query 1774  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG  1847
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1654  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAG  1727

Query 1848  GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            |||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1728  GGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1773