Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11611
• Subject: XM_006502325.2
• Aligned Length: 1398
• Identities: 1313
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGAGCCAGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCATCTGGAGGAAAAGGACCTGAAGCC  74

Query   75  CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTCGAGCAGTTTGGTCGGATCTTCGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148

Query  149  GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT  222
            ||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  GTGCTTTCCTGACGTACTGTGCTCGCGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGTGCCCTGCACGAACAGAAGACTCTC  222

Query  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296

Query  297  GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT  370

Query  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC  444

Query  445  AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC  518

Query  519  TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct  519  TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG  592

Query  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC  666

Query  667  AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG  740

Query  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG  814

Query  815  CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT  888
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT  888

Query  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCAGAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGCAGCAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAGCCCAGAGCCCGGCAGCCCCCGTGGACCCTCTCCAGCAGGC  962

Query  963  CTACGCGGGGATGCAGCACTACA---CAGCCTACCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC  1033
            |||.||.||.|||||||||||||   ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGCAGGAATGCAGCACTACACAGCAGCGTACCCCGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC  1036

Query 1034  CTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAG---  1104
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1037  CTCCAGCCCTGGTTGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAA  1110

Query 1105  CAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACTGACTC  1178
            ||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CAGCAGCAGCAACGGGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACAGACTC  1184

Query 1179  AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGAGCCACCAATC  1252
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGGGCCACCAATC  1258

Query 1253  AAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCCATGAATGGC  1326
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1259  AGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCTATGAACGGT  1332

Query 1327  TTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCCCTAC  1392
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1333  TTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCCCTAC  1398