Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11612
Subject:
NM_001351616.1
Aligned Length:
740
Identities:
594
Gaps:
146

Alignment

Query   1  -------------------------MELADVGAAASSQGVHDQVLPTPNASSRVIVHVDLDCFYAQVEMISNPE  49
                                    |||||||||||||                                    
Sbjct   1  MEKLGVEPEEEGGGDDDEEDAEAWAMELADVGAAASSQ------------------------------------  38

Query  50  LKDKPLGVQQKYLVVTCNYEARKLGVKKLMNVRDAKEKCPQLVLVNGEDLTRYREMSYKVTELLEEFSPVVERL  123
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  39  ------GVQQKYLVVTCNYEARKLGVKKLMNVRDAKEKCPQLVLVNGEDLTRYREMSYKVTELLEEFSPVVERL  106

Query 124  GFDENFVDLTEMVEKRLQQLQSDELSAVTVSGHVYNNQSINLLDVLHIRLLVGSQIAAEMREAMYNQLGLTGCA  197
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  | 
Sbjct 107  GFDENFVDLTEMVEKRLQQLQSDELSAVTVSGHVYNNQ----------------------------------C-  145

Query 198  GVASNKLLAKLVSGVFKPNQQTVLLPESCQHLIHSLNHIKEIPGIGYKTAKCLEALGINSVRDLQTFSPKILEK  271
                                                       ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146  --------------------------------------------IGYKTAKCLEALGINSVRDLQTFSPKILEK  175

Query 272  ELGISVAQRIQKLSFGEDNSPVILSGPPQSFSEEDSFKKCSSEVEAKNKIEELLASLLNRVCQDGRKPHTVRLI  345
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176  ELGISVAQRIQKLSFGEDNSPVILSGPPQSFSEEDSFKKCSSEVEAKNKIEELLASLLNRVCQDGRKPHTVRLI  249

Query 346  IRRYSSEKHYGRESRQCPIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTLLSVCFCNLKALNTA  419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250  IRRYSSEKHYGRESRQCPIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTLLSVCFCNLKALNTA  323

Query 420  KKGLIDYYLMPSLSTTSRSGKHSFKMKDTHMEDFPKDKETNRDFLPSGRIESTRTRESPLDTTNFSKEKDINEF  493
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324  KKGLIDYYLMPSLSTTSRSGKHSFKMKDTHMEDFPKDKETNRDFLPSGRIESTRTRESPLDTTNFSKEKDINEF  397

Query 494  PLCSLPEGVDQEVFKQLPVDIQEEILSGKSREKFQGKGSVSCPLHASRGVLSFFSKKQMQDIPINPRDHLSSSK  567
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398  PLCSLPEGVDQEVFKQLPVDIQEEILSGKSREKFQGKGSVSCPLHASRGVLSFFSKKQMQDIPINPRDHLSSSK  471

Query 568  QVSSVSPCEPGTSGFNSSSSSYMSSQKDYSYYLDNRLKDERISQGPKEPQGFHFTNSNPAVSAFHSFPNLQSEQ  641
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472  QVSSVSPCEPGTSGFNSSSSSYMSSQKDYSYYLDNRLKDERISQGPKEPQGFHFTNSNPAVSAFHSFPNLQSEQ  545

Query 642  LFSRNHTTDSHKQTVATDSHEGLTENREPDSVDEKITFPSDIDPQVFYELPEAVQKELLAEWKRAGSDFHIGHK  715
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546  LFSRNHTTDSHKQTVATDSHEGLTENREPDSVDEKITFPSDIDPQVFYELPEAVQKELLAEWKRAGSDFHIGHK  619