Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11696
• Subject: XM_006716441.1
• Aligned Length: 2650
• Identities: 1904
• Gaps: 725

Alignment

Query    1  ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC  74

Query   75  AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG  148

Query  149  ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC  222

Query  223  GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT  296

Query  297  GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG  370

Query  371  CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG  444

Query  445  GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA  518

Query  519  AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG  592

Query  593  AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC  666

Query  667  ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG  740

Query  741  CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG  814

Query  815  CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT  888

Query  889  GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGCCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA  962

Query  963  AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC  1036

Query 1037  TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT  1110

Query 1111  GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC  1184

Query 1185  CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA  1258

Query 1259  GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA  1332

Query 1333  GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA  1406

Query 1407  TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA  1480

Query 1481  AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC  1554

Query 1555  TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA  1628

Query 1629  GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC  1702

Query 1703  AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA  1776

Query 1777  AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTT--GGAAATAAA---GATGGA--G  1843
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||.|...|   ||||||  |
Sbjct 1777  AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGAGGACAGTTATGGGATGGATGG  1850

Query 1844  GAAGCT--------------------------------------------ATGACCTACACAGAATGT---TG-  1869
            ||||.|                                            |.||.||||||||  |||   || 
Sbjct 1851  GAAGGTTAATCAGCCCCGTCTCACTGCAGACATCAACTGGCAAGGCCTAGAGGAGCTACACAG--TGTGAATGA  1922

Query 1870  ------CT----GTTC---------------------CTGGTACCCTG-------------------TTCG---  1890
                  ||    ||.|                     |||||...|||                   ||.|   
Sbjct 1923  AAACATCTATGAGTACAGACAAAACTACAGACTTAGTCTGGTGGACTGGACTAATTACTTGAAGGATTTAGATA  1996

Query 1891  --------GCCCCTCTAACCTCCAGAG---CTATG-------------------GTCTCAGA-TGCT-------  1926
                    ||.|..||.|     ||||   |||||                   |.||||.| ||||       
Sbjct 1997  GAGTATTTGCACTGCTGA-----AGAGTCACTATGAGCAAAATAAAACAAATAAGACTCAAACTGCTCAAAGTG  2065

Query 1927  -----TCCTTT---------------------------------------------------------------  1932
                 |.|||.                                                               
Sbjct 2066  ACGGGTTCTTGGTTGTCTCTGCTGAGCACGCTGTGTCAATGGAGATGGCCTCTGCTGACTCAGATGAAGACCCA  2139

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2140  AGGCATAAGGTTGGGAAAACACCTCATTTGACCTTGCCAGCTGACCTTCAAACCCTGCATTTGAACCGACCAAC  2213

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2214  ATTAAGTCCAGAGAGTAAACTTGAATGGAATAACGACATTCCAGAAGTTAATCATTTGAATTCTGAACACTGGA  2287

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2288  GAAAAACCGAAAAATGGACGGGGCATGAAGAGACTAATCATCTGGAAACCGATTTCAGTGGCGATGGCATGACA  2361

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2362  GAGCTAGAGCTCGGGCCCAGCCCCAGGCTGCAGCCCATTCGCAGGCACCCGAAAGAACTTCCCCAGTATGGTGG  2435

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2436  TCCTGGAAAGGACATTTTTGAAGATCAACTATATCTTCCTGTGCATTCCGATGGAATTTCAGTTCATCAGATGT  2509

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2510  TCACCATGGCCACCGCAGAACACCGAAGTAATTCCAGCATAGCGGGGAAGATGTTGACCAAGGTGGAGAAGAAT  2583

Query 1933  ------------------------------------------------------------  1932
                                                                        
Sbjct 2584  CACGAAAAGGAGAAGTCACAGCACCTAGAAGGCAGCGCCTCCTCTTCACTCTCCTCTGAT  2643