Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11745
- Subject:
- XM_017316812.1
- Aligned Length:
- 1202
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 133
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------ATGGAGA 7
|||||..
Sbjct 1 ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT 74
Query 8 AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT 78
...||.|| |||| .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT 144
Query 79 ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC 152
||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 145 ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC 218
Query 153 CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA 225
||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 219 CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA 291
Query 226 CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA 296
|||||||..||.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 292 CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACA 365
Query 297 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 366 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAG 439
Query 371 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG------------------------------------------------- 395
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGC 513
Query 396 -----GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 514 TCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCAC 587
Query 465 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 588 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGC 661
Query 539 CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC 612
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGC 735
Query 613 TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT 686
||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 736 TTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACAT 809
Query 687 TCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGA 760
.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 810 CCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGA 883
Query 761 GGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTG 834
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 GGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTG 957
Query 835 GTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTAC 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTAC 1031
Query 909 TGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCG 982
|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1032 TGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTG 1105
Query 983 ACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTAC 1056
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1106 ACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTAC 1179
Query 1057 AGCCGATTTGCCCCCTAC 1074
||||||||||||||||||
Sbjct 1180 AGCCGATTTGCCCCCTAC 1197