Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11746
- Subject:
- NM_012276.5
- Aligned Length:
- 1497
- Identities:
- 1296
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACCCTCATTCTCACAAGCCTGCTCTTCTTTGGGCTGAGCCTGGGCCCCAGGACCCGGGTGCAGGCAGAAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTACTCAAACCCATCCTGTGGGCCGAGCCAGGTCCCGTGATCACCTGGCATAACCCCGTGACCATCTGGTGTC 148
Query 1 --------------------------------------------------ATGTCGAGGCACATATTAAAAACA 24
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGCACCCTGGAGGCCCAGGGGTACCGTCTGGATAAAGAGGGAAACTCAATGTCGAGGCACATATTAAAAACA 222
Query 25 CTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGTTA 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGTTA 296
Query 99 CTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGCCTACAGCAGACCCA 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGCCTACAGCAGACCCA 370
Query 173 CCCTGTCCGCCCTGCCAAGCCCTGTGGTAACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGCTGGGA 246
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTGTCCGCACTGCCAAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGCTGGGA 444
Query 247 CTGGGCAGGTTCACTCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCACACCAACACAACCA 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGCAGGTTCACTCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCACACCAACACAACCA 518
Query 321 TGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATTCAGATGCTACGGCT 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATTCAGATGCTACGGCT 592
Query 395 ATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGTCAGGCGTGTCTAGG 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGTCAGGCGTGTCTAGG 666
Query 469 AAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGA 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGA 740
Query 543 TGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGGCCGATGGCCTCCCCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCC 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGGCCGATGGCCTCCCCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCC 814
Query 617 AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC 888
Query 691 GGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGATCTC 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGATATCCTGATCGCAGGACAGATCTC 962
Query 765 TGACAGACCCTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGTGACCCTGCTGTGTCAGT 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACAGACCCTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGTGACCCTGCTGTGTCAGT 1036
Query 839 CATGGGACCCGATGTTCACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATG 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATGGGACCCGATGTTCACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATG 1110
Query 913 TACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTG 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTG 1184
Query 987 CTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAG 1258
Query 1061 CAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCCCCACACCTCCAGGATTACACAGTG 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCCCCACACCTCCAGGATTACACAGTG 1332
Query 1135 GAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGGGATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGGGATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCA 1406
Query 1209 CAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGGACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGG 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGGACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGG 1480
Query 1283 AGCCTTGGGAACAGATC 1299
|||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCCTTGGGAACAGATC 1497