Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11746
- Subject:
- XM_011547130.2
- Aligned Length:
- 1521
- Identities:
- 1023
- Gaps:
- 351
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC 148
Query 1 -------------------------------------------ATGTCGA-------GGCACATATTAAAAA-- 22
|.|.|.| ||.|||.| ||.||
Sbjct 149 AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGGGACAGA--AATAACC 220
Query 23 CACTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGT 96
|||||||..|..|.|||||||.||.|.||||||||||||||||||....|.|.|||||||||.||||.|.|||.
Sbjct 221 CACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGC 294
Query 97 TACTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAG---CCTACAGCAG 167
.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| .|||||.||.
Sbjct 295 CACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAA 368
Query 168 ACCCACCCTGTCCGCCCTGCCAAGCCCTGTGGTAACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGC 241
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|.|||..||||||||||.||||.|||||.|.
Sbjct 369 ACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGA 442
Query 242 TGGGACTGGGCAGGT-TCAC--------TCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCA 306
.|||| | |||| ||||||..||||||||||.|||..||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 443 AGGGA---------TATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCA 507
Query 307 CACCAACACAACCATGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATT 380
||.||.|.|.||..|||...||||||||||||||||||..||||||||.|||||..||||.|||||.|.|..||
Sbjct 508 CAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTT 581
Query 381 CAGATGCTACGGCTATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGT 454
||.||||||...||||.|.|..||||||||.|..||||||||..|.|||||||||||||||.||.|.|||...|
Sbjct 582 CACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCT 655
Query 455 CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTC 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||..|||..|||||||||
Sbjct 656 CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTC 729
Query 529 CAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGG-CCGATGGCCTCCCCCAGCGCC 601
||||||||||||||||||||||||..|||||....||||||.|||||||||| .|| ||.|.|||.||||||||
Sbjct 730 CAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACG-TGACTTCCTCCAGCGCC 802
Query 602 CTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGC 675
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 803 CTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGC 876
Query 676 CAGTACAGATGCTACGGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGAT 749
||||||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 877 CAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGAT 950
Query 750 CGCAGGACAGATCTCTGACAGACC--CTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGT 821
.|||||||||||||.|||| ||| ||||||.||||..||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 951 GGCAGGACAGATCTATGAC--ACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGT 1022
Query 822 GACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGACCCGATGTT-------CACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCAT 888
|||||||||||||||||||.||| ||| ||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1023 GACCCTGCTGTGTCAGTCACGGG-------GTTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCAT 1089
Query 889 CCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTC 962
|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 CCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTC 1163
Query 963 AGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGC 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 AGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGC 1237
Query 1037 CCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCC 1110
|||||||||||.|||||||| |||
Sbjct 1238 CCCTGGAGCTCATGGTCTCA---------------------------------------------------GCC 1260
Query 1111 CCACACCTCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGG 1184
.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1261 TCACACGCCAAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCATGGCAGGCTTGGTCCTGGTGTTCCTCGG 1334
Query 1185 GATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1335 GATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAA-ACCCCCAAGATGCAGCCGGGAGG--------------- 1392
Query 1259 ACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGGAGCCTTGGGAACAGATC 1299
Sbjct 1393 ----------------------------------------- 1392