Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11865
• Subject: XM_017016089.1
• Aligned Length: 1239
• Identities: 894
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  ------ATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGA----------  58
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGCTGATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGGGAGAAGAAGCAGAAGCCCATCTC  74

Query   59  --------------------------------------------------------------------------  58
                                                                                      
Sbjct   75  TGATGATGAAGCCAGTGATGGGGAAGAAACCCAGGTTAGTGCAGCTGATCTGGAAGCCCTCATCAGTGGCCACT  148

Query   59  --------------------------------------------------------------------------  58
                                                                                      
Sbjct  149  ACCCCACCTCCCTTGAGGGAGATTGTGAGCCTAGCCCAGCCCCTGCTGTCCTGGATAAGTGGGTCTGTGCACAG  222

Query   59  --------------------------------------------------------------------------  58
                                                                                      
Sbjct  223  CCCTCAAGCCAGAAGGCGACCAATCACAACCTCCATATCACAGAGAAGCTGGAAGTTCTGGCCAAAGCCTACAG  296

Query   59  --------------------------------------------------------------------------  58
                                                                                      
Sbjct  297  TGTTCAGGGAGACAAGTGGAGGGCCCTGGGCTATGCCAAGGCCATCAATGCCCTCAAGAGCTTCCATAAGCCTG  370

Query   59  ------------AGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTG  120
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCTCGTACCAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTG  444

Query  121  GAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTG  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTG  518

Query  195  GGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGG  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGG  592

Query  269  CCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAG  666

Query  343  GCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGG  740

Query  417  TTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACC  814

Query  491  GGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGA---------------------AGGGTTCCTCACA  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||
Sbjct  815  GGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGAAGCAGTCCCCTCTGTTGGGCCAGGGTTCCTCACA  888

Query  544  GATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGG  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGGGCCAGG  962

Query  618  GCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCG  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCG  1036

Query  692  GCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTC  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACATGCCCTC  1110

Query  766  AGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAA  1184

Query  840  GGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG  894
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG  1239