Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11865
• Subject: XM_024447945.1
• Aligned Length: 1023
• Identities: 871
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAACCGTTCCAGAGGGTCACTTCCGGCTGACTCGGAAGCTATTCTGGCCATTTGCCCTCCTTCCCCCCTT  74

Query    1  ---------------------ATG-CATCATCAAAAGTACTT--GCAAAGATTCCTAGGAGG----------GA  40
                                 .|| |.||||     ||.|||  ||       ||||.|..|          ||
Sbjct   75  CGTCCGCTCTCATTGGCTCTGCTGCCTTCAT-----GTGCTTCAGC-------CCTACGTTGTTTATGTCCAGA  136

Query   41  ---AGA---GGGAGAAGA------------AG---CAGAAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGG  93
               |||   .||||..||            ||   |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  ATCAGATATTGGAGCTGACTCTGCCTGTCCAGGGCCTGCAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGATTGGGAAGCGG  210

Query   94  ATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCC  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  ATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATTTGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCC  284

Query  168  TGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCC  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  TGTCTTGGAGCTCTTCTCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACAGGGCTTCC  358

Query  242  GAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGAC  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  GAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCCTGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGAC  432

Query  316  TTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  TTCCTGGAACGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTCCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAA  506

Query  390  CTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCA  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  CTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTGGTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCA  580

Query  464  TCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGAAGGGTTC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  TCACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGACAGTCTTCGGCAGGAAGGGTTC  654

Query  538  CTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGG  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  CTCACAGATGACTTGGTGAGCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTCCCAGG  728

Query  612  GCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACT  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTATAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACT  802

Query  686  TCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACAT  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  TCACCGGCTCTGCACACTTCAACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAACAT  876

Query  760  GCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCAC  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGGGCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCAC  950

Query  834  TGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG  894
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  TGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCTTAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG  1011