Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11945
• Subject: NM_016955.4
• Aligned Length: 1503
• Identities: 1323
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCGGGAGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAGGGCTGTGAGGCCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGGGCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTA  148

Query    1  --------------------------------ATGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAA  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAA  222

Query   43  AGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGG  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGG  296

Query  117  TGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGG  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGG  370

Query  191  ACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTA  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTA  444

Query  265  ACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAA  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAA  518

Query  339  GTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGC  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGC  592

Query  413  TGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCT  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCT  666

Query  487  ACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACAT  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACAT  740

Query  561  TCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAG  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAG  814

Query  635  TTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCT  888

Query  709  GGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGA  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGA  962

Query  783  TGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTT  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTT  1036

Query  857  CATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCC  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCC  1110

Query  931  ATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCT  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCT  1184

Query 1005  TTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCA  1258

Query 1079  GAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATG  1152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATG  1332

Query 1153  CAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAG  1226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAG  1406

Query 1227  TGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTG  1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTG  1480

Query 1301  ACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1323
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1503