Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11945
- Subject:
- XM_017008277.1
- Aligned Length:
- 1758
- Identities:
- 1323
- Gaps:
- 435
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCGGGAGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAGGGCTGTGAGGCCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGACGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGTTAATGTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CCAGGCTGATCTCAAACTCCTGACTTCAAGTGATCGGCCATTCTTGGCCTTCCAAAGTGCTCGGATTACAGGCG 370
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGGACAGC 9
|||||||||
Sbjct 371 GCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGC 444
Query 10 AACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCA 83
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCA 518
Query 84 TTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCC 157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCC 592
Query 158 TTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGC 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGC 666
Query 232 TTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGC 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGC 740
Query 306 AAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTG 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTG 814
Query 380 TGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAA 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAA 888
Query 454 CTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGA 962
Query 528 AGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAA 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAA 1036
Query 602 AGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAAT 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAAT 1110
Query 676 TTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTA 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTA 1184
Query 750 TCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATA 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATA 1258
Query 824 AGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTAC 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTAC 1332
Query 898 AATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCG 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCG 1406
Query 972 TGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTG 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTG 1480
Query 1046 GGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTAC 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTAC 1554
Query 1120 CTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTT 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTT 1628
Query 1194 AAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAG 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAG 1702
Query 1268 AAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1758
