Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11946
• Subject: NM_016955.4
• Aligned Length: 1541
• Identities: 1443
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGCAGTGTGACGATCT---------------------------CGGCTCAC-TGCAGC----CT-------CC  35
            |||.|..|.|| ||.||                           |||||.|| |||.||    ||       ||
Sbjct    1  ATGAACCGCGA-GAGCTTCGCGGCGGGAGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAGGGCTGTGAGGCCC  73

Query   36  GC--CTCCCGGGTTCACGCCATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACA  107
            ||  |||.|..|..|||..|||.||.||||.||.|      |||.|                            
Sbjct   74  GCCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTG------GAGAA----------------------------  113

Query  108  CCCGGGCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGG  181
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  ---GGGCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGG  184

Query  182  ACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGT  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  ACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGT  258

Query  256  CGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTC  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  CGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTC  332

Query  330  TAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCA  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  TAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCA  406

Query  404  ACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCA  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  ACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCA  480

Query  478  AAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGA  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGA  554

Query  552  GCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCC  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCC  628

Query  626  AGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  AGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGA  702

Query  700  TTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTC  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  TTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTC  776

Query  774  TTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACA  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  TTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACA  850

Query  848  AAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAG  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  AAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAG  924

Query  922  ATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  ATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGG  998

Query  996  CTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAG  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  CTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAG  1072

Query 1070  CCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAA  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  CCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAA  1146

Query 1144  CACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCC  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  CACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCC  1220

Query 1218  TCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTG  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221  TCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTG  1294

Query 1292  CTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGG  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295  CTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGG  1368

Query 1366  TGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATAT  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369  TGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATAT  1442

Query 1440  TGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1500
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443  TGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1503