Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11946
• Subject: NM_172490.4
• Aligned Length: 1551
• Identities: 1266
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGCAGTGTGACGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCGCC---TGCCTCAGCCT  71
                      |.||.|.|||        ||    .||.||.|||   |..||.| .||.|   ||.|||.|.||
Sbjct    1  ----------ATGAACCCGG--------AG----AGCTTCGCGG---CGGGCGA-GCGGCGGGTGTCTCCGGCT  48

Query   72  CCCGAGTAGCTGGGACTAC-AGGC---GCCCGC-------CACCACACCC----------------GGGCAAGT  118
            ..||.|..||.||| ||.| ||||   ||.|||       ||||.||.||                ||||||||
Sbjct   49  TACGTGAGGCAGGG-CTGCGAGGCTCGGCGCGCCCACGAGCACCTCATCCGGCTGCTTCTAGAGCAGGGCAAGT  121

Query  119  GTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGCAACAAT  192
            ||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||||.||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  122  GTCCAGAGGATGGCTGGGATGAAAGTACCCTCGAACTCTTTCTGCATGAGCTTGCAGTCATGGATAGCAACAAT  195

Query  193  TTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCATTACAG  266
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.||.||||||||
Sbjct  196  TTCTTGGGTAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCCTCTGCTTTGGTTGCTCGACGACATTACAG  269

Query  267  GTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTTTTGA  340
            ||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  270  GTTCATCCACGGAATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCCTCTTGA  343

Query  341  ACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGCTTTGTA  414
            ||||||||||.|||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||.|||.||||.||||..|||||||||
Sbjct  344  ACAAAATTACTAATTCTTTGGTGCTTAATGTCATAAAGCTTGCTGGTGTTCATTCAGTGGCCAGTTGCTTTGTA  417

Query  415  GTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGCAAAGTA  488
            |||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  418  GTTCCTATGGCAACTGGGATGAGTCTAACCTTGTGTTTCCTGACACTACGACACAAAAGACCAAAGGCCAAGTA  491

Query  489  TATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTGTGGTGA  562
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  492  TATCATATGGCCACGGATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAGTCCATGGTCACTGCAGGTTTTGAACCCGTGGTAA  565

Query  563  TAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTGGG  636
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||
Sbjct  566  TAGAAAACGTATTGGAAGGTGATGAGCTGCGCACAGACCTGAAAGCCGTGGAGGCTAAAATCCAGGAGCTCGGG  639

Query  637  CCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGAAGAACT  710
            ||.||...|||.|||||..||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  640  CCGGAGCACATCCTGTGCCTTCATTCTACCACAGCCTGCTTTGCTCCAAGGGTGCCCGATAGATTAGAAGAACT  713

Query  711  GGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAAAGTGTA  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.|||||||||.|.||||||||||||||.|
Sbjct  714  GGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATGTAGTCAACAACGCTTATGGATTACAGTCTTCAAAGTGCA  787

Query  785  TGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATG  858
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  TGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGGGTTGGTAGAATTGATGCTTTCGTTCAGAGCTTGGACAAAAATTTTATG  861

Query  859  GTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGG  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGAGCCCTTCATTCAGGACATCAGCAAGATGTATCCAGG  935

Query  933  AAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATAAGAAGC  1006
            ||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||.||..|||||||.||.|..|.||||||.|.|||||
Sbjct  936  AAGAGCCTCAGCCTCGCCGTCCTTAGACGTCCTCATCACCTTGCTGTCACTGGGCTGCAGTGGCTACAGGAAGC  1009

Query 1007  TACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTT-TCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTACAATGA  1079
            |..|.||.||.||||||||||||||| || |||||.||||.||||.|||||||||||.||||.|||.|||||||
Sbjct 1010  TGTTGAAGGAGAGAAAGGAAATGTTTGTC-TATTTATCCACCCAACTAAAGAAGTTGGCAGAGGCCCACAATGA  1082

Query 1080  AAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCGTGACA  1153
            ||||||..|.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||..||||||.|||||.|||||
Sbjct 1083  AAGACTACTACAGACACCTCACAACCCTATATCCTTAGCTATGACACTTAAGACGATAGATGGACACCATGACA  1156

Query 1154  AAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTGGGTCC  1227
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1157  AAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCAATGCTTTTTACCAGACAAGTGTCTGGAGCCAGGGCTGTGCCTCTTGGGAAC  1230

Query 1228  ATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTACCTCAA  1301
            .|||||||||||||||||.|||||||..|||||||.|||||.|||.||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1231  GTGCAAACTGTGAGTGGCCATACTTTTCGAGGCTTCATGTCCCATGCAGATAATTACCCCTGTGCTTACCTCAA  1304

Query 1302  TGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTTAAAGG  1375
            |||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||..
Sbjct 1305  TGCGGCAGCAGCCATCGGGATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAAGTGCTTAAACA  1378

Query 1376  CAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATG----------------ACAAAACTGAAGATGT  1433
            .||||||.|||||||..|.||.||..||||       ||.||                |||||.|||||||||.
Sbjct 1379  TAGTAAGGAAAGAACAGACTAGAGCAAGTG-------TTGTGTCTGGAGCTGACCGCAACAAAGCTGAAGATGC  1445

Query 1434  GGATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACAT----ACCAGGATGCTTCTTCA  1500
            |||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||.|||...|    ||    .|||||...||.||..|
Sbjct 1446  GGACATTGAGGAAATGGCTTTGAAACTGGATGACGTGCTTGGGG----ATGTGGGCCAGGGCCCTGCTCTA  1512