Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11946
- Subject:
- XM_017008277.1
- Aligned Length:
- 1758
- Identities:
- 1500
- Gaps:
- 258
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCGGGAGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAGGGCTGTGAGGCCCG 74
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGCAGTG 8
||||||||
Sbjct 75 CCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGAGTCTCGCTCTTTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTG 148
Query 9 TGACGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGACGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 222
Query 83 GGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCG--------------------------------------------- 111
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGTTAATGTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGG 296
Query 112 -------------------------------------------------------------------------G 112
|
Sbjct 297 CCAGGCTGATCTCAAACTCCTGACTTCAAGTGATCGGCCATTCTTGGCCTTCCAAAGTGCTCGGATTACAGGCG 370
Query 113 GCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGC 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCAAGTGTCCAGAGAATGGCTGGGATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCAATCATGGACAGC 444
Query 187 AACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCA 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGCTCGTCGTCA 518
Query 261 TTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCC 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAGGCTCTAGCC 592
Query 335 TTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGC 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTAGCCAACTGC 666
Query 409 TTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGC 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAGACCAAAGGC 740
Query 483 AAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTG 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTTTTGAGCCTG 814
Query 557 TGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAA 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAA 888
Query 631 CTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGA 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGATAGATTAGA 962
Query 705 AGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGCAGTCTTCAA 1036
Query 779 AGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAAT 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTGGACAAAAAT 1110
Query 853 TTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTA 1184
Query 927 TCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAAATGGCTATA 1258
Query 1001 AGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTAC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCAGAAGCCTAC 1332
Query 1075 AATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGATGAACACCG 1406
Query 1149 TGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTG 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTGTGCCTCTTG 1480
Query 1223 GGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTAC 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCTTGTGCTTAC 1554
Query 1297 CTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTT 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGACAGGTGTTT 1628
Query 1371 AAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAG 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGGATATTGAAG 1702
Query 1445 AAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA 1758