Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11953
- Subject:
- XM_017019389.2
- Aligned Length:
- 2011
- Identities:
- 1392
- Gaps:
- 602
Alignment
Query 1 ATGTTAATTGATGAAAGGTTACGATGTGAGCATCATAAAGCTAATTATCAGACACTGAAGGCTGAACACACAAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTGCAGAATGAACATGTAAAGTTACAAAATGAACTCAAGCACCTGTTTAATGAAAAGCAAACTCAGCAGGAAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACTTCAGCTCCTGCTTGAAGAACTAAGAGGAGAATTAGTAGAGAAAACTAAAGATTTAGAAGAAATGAAACTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGATATTAACTCCACAAAAATTGGAATTGCTAAGAGCCCAAATACAACAAGAATTAGAAACTCCAATGAGAGA 296
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGAGAGA 8
Query 297 ACGTTTTAGGAATCTAGATGAAGAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATATAATAAGCTTCGCTATGAACATACAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 ACGTTTTAGGAATCTAGATGAAGAGGTAGAAAAGTATAGAGCTGTATATAATAAGCTTCGCTATGAACATACAT 82
Query 371 TTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTTAGATGAAGGAAAAATAAAATATGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 TTCTCAAGTCAGAATTTGAACACCAGAAGGAAGAGTATGCACGTATTTTAGATGAAGGAAAAATAAAATATGAA 156
Query 445 TCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGCTGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 TCAGAGATTGCAAGACTGGAGGAAGATAAAGAAGAACTACGTAACCAGCTGCTTAATGTTGATCTCACAAAAGA 230
Query 519 CAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAAAAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 CAGCAAACGAGTGGAACAACTTGCTCGAGAAAAAGTCTATTTGTGTCAAAAATTAAAAGGTTTAGAGGCTGAAG 304
Query 593 TAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAATGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 TAGCGGAATTAAAGGCTGAAAAGGAGAATTCTGAGGCTCAGGTGGAAAATGCCCAAAGAATACAGGTGCGGCAG 378
Query 667 TTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAATCAGCTAATTTACGGGCAGAACGCTT 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 379 TTGGCTGAGATGCAGGCTACAGTCAGATCCCTGGAGGCTGAAAAACAATCAGCTAATTTACGGGCAGAACGTTT 452
Query 741 GGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAATAAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GGAAAAAGAGCTACAATCAAGCAGTGAACAAAATACCTTTTTAATTAATAAATTGCATAAAGCTGAACGAGAAA 526
Query 815 TAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACTGGAAATAACAGACATCAAACTGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 TAAATACATTGTCCAGTAAAGTAAAAGAACTTAAACATTCAAACAAACTGGAAATAACAGACATCAAACTGGAG 600
Query 889 ACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAAGTGAACTGGATGGATTACAGTCAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACAGCAAGAGCTAAGAGTGAGCTAGAAAGAGAAAGGAATAAGATTCAAAGTGAACTGGATGGATTACAGTCAGA 674
Query 963 CAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTAGAAAAGGATCGTGAATTAATACGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 CAATGAAATTCTCAAAGCAGCTGTTGAACATCACAAAGTGCTCTTAGTAGAAAAGGATCGTGAATTAATACGTA 748
Query 1037 AAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACAAGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 AAGTACAAGCTGCCAAAGAAGAAGGTTATCAAAAACTTGTGGTATTACAAGATGAAAAGTTAGAACTCGAGAAC 822
Query 1111 AGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGCAATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 AGATTAGCAGATTTGGAGAAAATGAAAGTGGAACATGATGTCTGGAGGCAATCTGAAAAGGATCAGTATGAAGA 896
Query 1185 GAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTTCAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GAAATTGCGGGCTTCACAGATGGCAGAAGAGATCACCAGGAAGGAGCTTCAGAGTGTTAGGTTAAAACTTCAGC 970
Query 1259 AACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTCTGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 AACAAATTGTGACTATTGAAAATGCAGAGAAGGAAAAAAATGAAAATTCTGACCTAAAACAGCAAATCAGTAGT 1044
Query 1333 TTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGAATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 TTGCAGATCCAAGTGACTTCACTTGCACAGTCAGAGAATGACTTGCTGAATTCAAACCAAATGCTGAAGGAAAT 1118
Query 1407 GGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAAAAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 GGTGGAGAGATTAAAACAAGAATGCCGAAATTTTAGAAGCCAAGCTGAAAAAGCGCAACTAGAAGCTGAAAAGA 1192
Query 1481 CATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCATGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 CATTGGAAGAGAAACAGATACAGTGGTTGGAAGAAAAGCATAAGCTTCATGAGCGTATCACAGACAGAGAAGAA 1266
Query 1555 AAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGAAAAAG---------CTTGA------ 1613
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.|
Sbjct 1267 AAGTACAATCAAGCTAAGGAGAAACTGCAGCGAGCTGCAATTGCCCAGAAAAAGAGAAAATCTCTTCATGAAAA 1340
Query 1614 ---------------ACAGGA-----------TCTT----------------GAGTTGG--------------- 1630
|||.|| |||| ||.||||
Sbjct 1341 CAAATTGAAAAGACTACAAGAGAAAGTAGAAGTCTTGGAGGCAAAGAAAGAAGAATTGGAAACAGAAAATCAGG 1414
Query 1631 --------------GATG-CCCTTCTG-TGACTGATAC-------------------------ATACAGAGA-- 1661
.||| .||||.|| .|||| |||| |||||||||
Sbjct 1415 TCTTAAATAGACAAAATGTTCCTTTTGAAGACT-ATACAAGGCTTCAAAAAAGACTAAAAGATATACAGAGAAG 1487
Query 1662 ---------------GAGTGTA-------TTCCCCCCA--CCCCCATTGAAGAGAG-ATCT------------- 1697
.|||.|| ||||...|| ||.||| |.|| ||||
Sbjct 1488 ACATAATGAATTTCGAAGTCTAATTTTGGTTCCTAACATGCCTCCA------ACAGCATCTATCAATCCTGTTA 1555
Query 1698 -CTTGAAG------------------------------------------------------------------ 1704
|||..||
Sbjct 1556 GCTTTCAGTCATCAGCCATGGTTCCAAGCATGGAACTACCATTTCCTCCTCATATGCAGGAGGAACAACATCAA 1629
Query 1705 -------------------------------------------------------------------------- 1704
Sbjct 1630 AGGGAACTCTCTCTACTTCGCAAAAGACTAGAAGAACTGGAAACAACACAAAGAAAACAACTAGAGGAACTTGG 1703
Query 1705 ------------- 1704
Sbjct 1704 ATCTTCCGGAGAA 1716