Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11984
• Subject: XM_024449013.1
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1479
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT  74

Query   75  TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG  148

Query  149  AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT  222

Query  223  CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC  296

Query  297  CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  370

Query  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  444

Query  445  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  518

Query  519  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAG-------------------------  567
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  519  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGGTGGGGAAGAGGCACAGGCCCAACC  592

Query  568  ----------------------------TGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  613
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGGGCTCCTGATTCTAATCTCCAGCCATGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  666

Query  614  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  740

Query  688  ATGGCCGAGGCTGAG----------------------------------------GGTGCTGTGCCGTTCCTGG  721
            |||||||||||||||                                        |||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGGCCGAGGCTGAGGTTGACTTTTCACTTTTTTGAAACTTTTATTTTGGATTCAGGTGCTGTGCCGTTCCTGG  814

Query  722  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  888

Query  796  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  962

Query  870  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  1036

Query  944  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  1110

Query 1018  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  1184

Query 1092  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  1258

Query 1166  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  1332

Query 1240  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  1406

Query 1314  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1480

Query 1388  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1554

Query 1462  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1572