Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12027
- Subject:
- XM_011542871.1
- Aligned Length:
- 3078
- Identities:
- 1850
- Gaps:
- 1227
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTTCCTCTTGGAAACTAATGCTGTTTCTGTCAGTCACCATGTGTCTTTCAGAAAGTGTGGACTATGGGCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTTTTTGTGCAAGAACCAGATGATATTATTTTTCCAACTGATTCTGATGAAAAGAAGGTAGCATTGAATTGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAGTTCGTGGCAATCCAGTTCCCAGTTACAGATGGCTTCGAAATGGAACAGAAATAGATCTGGAAAGTGATTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGCTACAGTTTGATAGATGGCACCTTCATTATAAGCAATCCAAGTGAAGCAAAGGATTCTGGTCATTATCAGTG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TTTAGCAACCAACACTGTGGGGAGTATTCTTAGTAGAGAAGCTACACTGCAGTTTGCCTATCTGGGAAATTTTA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GTGGCCGGACAAGAAGTGCAGTCTCTGTGAGGGAAGGCCAGGGTGTCGTTCTGATGTGCTCTCCTCCGCCACAT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCACCAGAGATCATCTATAGCTGGGTATTTAATGAGTTCCCTTCCTTTGTGGCGGAAGACAGCCGGCGGTTCAT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CTCCCAGGAGACAGGCAACCTTTATATTTCTAAAGTCCAAACATCAGATGTTGGCAGCTATATTTGTCTGGTGA 592
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGGA 6
||||||
Sbjct 593 AAAACACAGTGACGAATGCTAGAGTCCTTAGTCCTCCAACGCCACTCACTCTGCGTAATGATGGTGTGATGGGA 666
Query 7 GAATATGAGCCGAAAATTGAGGTCCATTTTCCTTTCACGGTTACAGCTGCTAAAGGAACAACTGTTAAGATGGA 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAATATGAGCCGAAAATTGAGGTCCATTTTCCTTTCACGGTTACAGCTGCTAAAGGAACAACTGTTAAGATGGA 740
Query 81 ATGCTTTGCACTTGGCAACCCCGTTCCAACAATCACATGGATGAAGGTTAATGGTTATATTCCTAGTAAGGCAC 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGCTTTGCACTTGGCAACCCCGTTCCAACAATCACATGGATGAAGGTTAATGGTTATATTCCTAGTAAGGCAC 814
Query 155 GTCTGCGGAAATCTCAGGCGGTGCTGGAAATACCGAATGTACAGCTGGATGATGCAGGCATTTATGAGTGCAGA 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTCTGCGGAAATCTCAGGCGGTGCTGGAAATACCGAATGTACAGCTGGATGATGCAGGCATTTATGAGTGCAGA 888
Query 229 GCTGAAAACTCACGTGGAAAAAATTCCTTTCGTGGACAATTACAAGTATACACCTACCCACACTGGGTAGAAAA 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTGAAAACTCACGTGGAAAAAATTCCTTTCGTGGACAATTACAAGTATACACCTACCCACACTGGGTAGAAAA 962
Query 303 ACTGAATGATACTCAGTTAGACAGTGGGAGCCCTCTCCGATGGGAATGTAAGGCTACTGGAAAACCCAGACCCA 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTGAATGATACTCAGTTAGACAGTGGGAGCCCTCTCCGATGGGAATGTAAGGCTACTGGAAAACCCAGACCCA 1036
Query 377 CGTATCGTTGGCTGAAGAATGGAGTACCCCTCTCACCTCAGAGTAGGGTTGAGATGGTTAATGGAGTATTGATG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGTATCGTTGGCTGAAGAATGGAGTACCCCTCTCACCTCAGAGTAGGGTTGAGATGGTTAATGGAGTATTGATG 1110
Query 451 ATCCACAATGTGAATCAATCAGATGCTGGAATGTATCAGTGTTTGGCTGAAAATAAGTATGGAGCCATTTACGC 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCCACAATGTGAATCAATCAGATGCTGGAATGTATCAGTGTTTGGCTGAAAATAAGTATGGAGCCATTTACGC 1184
Query 525 TAGTGCTGAGCTGAAGATTCTAGCTTCAGCTCCCACTTTTGCACTGAATCAACTGAAGAAAACAATAATTGTTA 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGTGCTGAGCTGAAGATTCTAGCTTCAGCTCCCACTTTTGCACTGAATCAACTGAAGAAAACAATAATTGTTA 1258
Query 599 CCAAAGACCAAGAAGTTGTCATAGAGTGCAAACCCCAAGGCTCTCCAAAACCAACCATCTCTTGGAAGAAAGGA 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCAAAGACCAAGAAGTTGTCATAGAGTGCAAACCCCAAGGCTCTCCAAAACCAACCATCTCTTGGAAGAAAGGA 1332
Query 673 GACAGAGCAGTTAGAGAAAACAAAAGAATAGCTATTCTTCCAGACGGGAGTCTACGGATCCTAAATGCTTCCAA 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACAGAGCAGTTAGAGAAAACAAAAGAATAGCTATTCTTCCAGACGGGAGTCTACGGATCCTAAATGCTTCCAA 1406
Query 747 ATCAGACGAGGGAAAGTACGTTTGCCGAGGGGAAAACGTCTTTGGTTCTGCTGAAATTATAGCTTCGCTATCTG 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCAGACGAGGGAAAGTACGTTTGCCGAGGGGAAAACGTCTTTGGTTCTGCTGAAATTATAGCTTCGCTATCTG 1480
Query 821 TAAAAGAACCTACAAGGATAGAACTTACTCCTAAAAGAACAGAATTGACAGTGGGAGAAAGCATTGTCCTTAAT 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TAAAAGAACCTACAAGGATAGAACTTACTCCTAAAAGAACAGAATTGACAGTGGGAGAAAGCATTGTCCTTAAT 1554
Query 895 TGCAAAGCAATTCACGATGCTAGTTTGGATGTCACTTTCTACTGGACTCTGAAAGGACAGCCTATTGATTTCGA 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCAAAGCAATTCACGATGCTAGTTTGGATGTCACTTTCTACTGGACTCTGAAAGGACAGCCTATTGATTTCGA 1628
Query 969 GGAAGAGGGTGGACATTTTGAAAGCATCAGGGCCCAAGCATCCTCTGCAGATTTAATGATCAGGAACATCCTTC 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAAGAGGGTGGACATTTTGAAAGCATCAGGGCCCAAGCATCCTCTGCAGATTTAATGATCAGGAACATCCTTC 1702
Query 1043 TGATGCATGCTGGGAGATATGGCTGCAGGGTACAGACCACAGCAGACAGTGTGTCAGATGAGGCAGAACTTCTT 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGATGCATGCTGGGAGATATGGCTGCAGGGTACAGACCACAGCAGACAGTGTGTCAGATGAGGCAGAACTTCTT 1776
Query 1117 GTTAGGGGACCCCCAGGCCCACCTGGGATAGTAATTGTTGAGGAAATAACCGAAAGTACGGCCACACTGTCCTG 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTTAGGGGACCCCCAGGCCCACCTGGGATAGTAATTGTTGAGGAAATAACCGAAAGTACGGCCACACTGTCCTG 1850
Query 1191 GAGCCCAGCAGCTGACAACCACAGCCCAATCTCCTCCTACAACCTTCAAGCTCGCAGCCCATTTTCCCTGGGCT 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAGCCCAGCAGCTGACAACCACAGCCCAATCTCCTCCTACAACCTTCAAGCTCGCAGCCCATTTTCCCTGGGCT 1924
Query 1265 GGCAAACAGTAAAGACAGTCCCAGAAATCATAACAGGGGACATGGAGTCAGCCATGGCTGTGGACCTAAATCCC 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCAAACAGTAAAGACAGTCCCAGAAATCATAACAGGGGACATGGAGTCAGCCATGGCTGTGGACCTAAATCCC 1998
Query 1339 TGGGTGGAATATGAATTTCGAGTGGTAGCCACCAACCCTATTGGGACAGGAGATCCAAGCACCCCATCTCGAAT 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGGGTGGAATATGAATTTCGAGTGGTAGCCACCAACCCTATTGGGACAGGAGATCCAAGCACCCCATCTCGAAT 2072
Query 1413 GATCCGCACAAATGAAGCAGTTCCGAAGACAGCACCCACCAATGTAAGCGGAAGAAGTGGAAGAAGGCATGAGT 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GATCCGCACAAATGAAGCAGTTCCGAAGACAGCACCCACCAATGTAAGCGGAAGAAGTGGAAGAAGGCATGAGT 2146
Query 1487 TAGTCATTGCCTGGGAGCCAGTATCTGAAGAGTTTCAGAATGGGGAAGGCTTCGGCTATATTGTGGCTTTCAGA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TAGTCATTGCCTGGGAGCCAGTATCTGAAGAGTTTCAGAATGGGGAAGGCTTCGGCTATATTGTGGCTTTCAGA 2220
Query 1561 CCCAATGGAACACGTGGCTGGAAGGAAAAAATGGTGACATCCTCTGAAGCTTCCAAATTCATTTATCGAGATGA 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCAATGGAACACGTGGCTGGAAGGAAAAAATGGTGACATCCTCTGAAGCTTCCAAATTCATTTATCGAGATGA 2294
Query 1635 AAGTGTCCCTCCTCTTACTCCCTTTGAAGTGAAAGTTGGCGTTTATAACAATAAAGGAGATGGGCCTTTTAGTC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AAGTGTCCCTCCTCTTACTCCCTTTGAAGTGAAAGTTGGCGTTTATAACAATAAAGGAGATGGGCCTTTTAGTC 2368
Query 1709 AAATTGTGGTCATCTGTTCAGCTGAAGGAGAACCCAGTGCTGCTCCCACAGATGTCAAGGCGACAAGTGTGTCT 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAATTGTGGTCATCTGTTCAGCTGAAGGAGAACCCAGTGCTGCTCCCACAGATGTCAAGGCGACAAGTGTGTCT 2442
Query 1783 GTGTCAGAGATTCTTGTTGCATGGAAACACATTAAAGAGAGTCTAGGAAGACCACAGGGATTTGAGGTA----- 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2443 GTGTCAGAGATTCTTGTTGCATGGAAACACATTAAAGAGAGTCTAGGAAGACCACAGGGATTTGAGGTTGGTTA 2516
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2517 CTGGAAAGACATGGAACAGGAAGATACAGCAGAAACAGTCAAAACTAGAGGGAATGAGTCTTTCGTCATCCTAA 2590
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2591 CAGGATTAGAAGGAAATACGTTATATCACTTCACAGTGAGGGCTTACAATGGAGCTGGATATGGGCCACCTAGC 2664
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2665 AGTGAAGTGAGTGCAACCACCAAGAAATCCCCTCCTAGTCAAGCACCTAGCAACCTCAGGTGGGAGCAGCAAGG 2738
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2739 CTCTCAGGTTTCTCTGGGCTGGGAACCCGTCATACCATTAGCCAACGAATCTGAAGTTGTGGGTTACAAGGTTT 2812
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2813 TTTATAGGCAAGAGGGTCACAGCAACAGCCAAGTTATTGAAACACAGAAACTTCAAGCAGTAGTACCACTCCCA 2886
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2887 GATGCTGGAGTCTATATTATTGAAGTTCGAGCATATAGTGAAGGAGGAGATGGAACAGCTAGTTCTCAAATTAG 2960
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2961 GGTACCATCATATTCAGGTGGAAAAATCACAAGTGCACAGTCGACCCTTCACTCTCTCTCCACATCTTCGTCAT 3034
Query 1852 -------------------------------------------- 1851
Sbjct 3035 CAGTCACCTTGCTCTTGGCATTGATGATTCCTTCAACTTCCTGG 3078