Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12028
• Subject: XM_006513920.3
• Aligned Length: 1181
• Identities: 874
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGGTGACGCCATCTGGGCCCCACCCATCCTTCCTCACAGCACCCTCGGCACCTTAAGCCACCACCC  74

Query    1  ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC  52
                                  |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTACATTTTGGAGGGAAGATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCC  148

Query   53  TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG  126
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TACTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAG  222

Query  127  AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC  200
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGTGGCGCCAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGC  296

Query  201  CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG  274
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCTTCAAGGCCTTTGCTATGATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTG  370

Query  275  CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA  348
            |||||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCACCAGCAAGCCTCCAGTGACACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGT  444

Query  349  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC  422
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCCGGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTC  518

Query  423  CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA  496
            |||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGAGCGGGCAGTGACTATCTCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCA  592

Query  497  TGCTGGAG------------------------------------------------------------------  504
            ||||||||                                                                  
Sbjct  593  TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA  666

Query  505  --------------------------------------------------------------------------  504
                                                                                      
Sbjct  667  GGTGGTCAGGTAAGAGCCGACCCGCTCGCGGCCTCCACTGCCAACCTCAGCCTTTTACTGCAGCATCCGCCGCT  740

Query  505  ----GCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGC  574
                |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCGCCTACACAATCCAGGGACAGTACGCCATCCCCCACCCAGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGC  814

Query  575  AGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCC  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCC  888

Query  649  GAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCAC  722
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCGTCAGGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCAC  962

Query  723  CATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTG  796
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CATTCCCAATGATCTTATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACAGATGTCTG  1036

Query  797  GAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCC  870
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1037  GAGCTCAGATCAAAATCGCCAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGACCCCAGCC  1110

Query  871  AACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCACGCTG  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||  ||||.|  
Sbjct 1111  AACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCACTC--  1179