Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12028
• Subject: XM_006513926.3
• Aligned Length: 1112
• Identities: 815
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGGTGACGCCATCTGGGCCCCACCCATCCTTCCTCACAGCACCCTCGGCACCTTAAGCCACCACCC  74

Query    1  ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC  52
                                  |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTACATTTTGGAGGGAAGATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCC  148

Query   53  TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG  126
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TACTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAG  222

Query  127  AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC  200
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGTGGCGCCAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGC  296

Query  201  CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG  274
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCTTCAAGGCCTTTGCTATGATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTG  370

Query  275  CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA  348
            |||||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCACCAGCAAGCCTCCAGTGACACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGT  444

Query  349  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC  422
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCCGGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTC  518

Query  423  CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA  496
            |||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGAGCGGGCAGTGACTATCTCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCA  592

Query  497  TGCTGG--------------------------------------------------------------------  502
            ||||||                                                                    
Sbjct  593  TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA  666

Query  503  -------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGC  569
                   |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTACGCCATCCCCCACCCAGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGC  740

Query  570  CATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACT  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  741  CATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCC----------------------  792

Query  644  CCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAG  717
                                                  ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  --------------------------------------GGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAG  828

Query  718  CTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGAT  791
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  829  CTCACCATTCCCAATGATCTTATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACAGAT  902

Query  792  GTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCC  865
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  903  GTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGACCC  976

Query  866  CGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCACGC  937
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||  ||||.|
Sbjct  977  CAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCACTC  1050

Query  938  TG  939
              
Sbjct 1051  --  1050