Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12028
- Subject:
- XM_011243517.2
- Aligned Length:
- 1088
- Identities:
- 874
- Gaps:
- 151
Alignment
Query 1 ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGT 74
|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCCTACTGATGCATGGAAAGGAAGT 74
Query 75 TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAGAGTGGCGCCAGGATCAACATCT 148
Query 149 CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATG 222
||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCTATG 222
Query 223 ATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGAC 296
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 ATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCTCCAGTGAC 296
Query 297 GCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCA 370
.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 297 ACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGTGGCTCCAAGATCAAGGAGATCC 370
Query 371 GGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATC 444
||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 371 GGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTCCACAGAGCGGGCAGTGACTATC 444
Query 445 TCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCATGCTGGAG-------------- 504
||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGG 518
Query 505 -------------------------------------------------------------------------- 504
Sbjct 519 TGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCAGGTGGTCAGGTAAGAGCCGACC 592
Query 505 --------------------------------------------------------GCCTACACAATCCAGGGA 522
||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGCTCGCGGCCTCCACTGCCAACCTCAGCCTTTTACTGCAGCATCCGCCGCTGCCCGCCTACACAATCCAGGGA 666
Query 523 CAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCC 593
|||||.||||||||.|||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGTACGCCATCCCCCACCCAGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCC 740
Query 594 CCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGA 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGA 814
Query 668 TGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATA 741
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 TGGGCCAGTCGTCAGGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTTATA 888
Query 742 GGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGC 815
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGC 962
Query 816 CAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGT 889
|||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGACCCCAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGT 1036
Query 890 ATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCACGCTG 939
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||| ||||.|
Sbjct 1037 ATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCACTC-- 1086