Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: NM_001256787.1
• Aligned Length: 1098
• Identities: 874
• Gaps: 224

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MTSEEKKERPISMINEASNYNVTSDYAVHPMSPVGRTSRASKKVHNFGKRSNSIKRNPNAPVVRRGWLYKQDST  74

Query    1  ------------------------------------------------------------MRTYYFCTDTGKEM  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct   75  GMKLWKKRWFVLSDLCLFYYRDEKEEGILGSILLPSFQIALLTSEDHINRKYAFKAAHPNMRTYYFCTDTGKEM  148

Query   15  ELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITSENAPTKETNNIPNHRVLIKPEIQNNQKNKEMSKIEEKKALEAEKYGFQ  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITSENAPTKETNNIPNHRVLIKPEIQNNQKNKEMSKIEEKKALEAEKYGFQ  222

Query   89  KDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPINLSSSENKIVNVSLADLRGGNRPNTGPLYTEADRV  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPINLSSSENKIVNVSLADLRGGNRPNTGPLYTEADRV  296

Query  163  IQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPSHRAQIMARYPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTPS  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  IQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPSHRAQIMARYPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTPS  370

Query  237  THDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTLPRHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTSPSHGSIAA  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  THDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTLPRHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTSPSHGSIAA  444

Query  311  YQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVPDRRSVPAGLTLQSVSPQSLQGKT-----------  373
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  445  YQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVPDRRSVPAGLTLQSVSPQSLQGKTMKENEPIITMV  518

Query  374  ----------------LSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSA  431
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  HTMIENSALRPQLYQQLSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSA  592

Query  432  SQEIEMHADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQ  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SQEIEMHADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQ  666

Query  506  TESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTEIGMIGSKPFSTVKYKNE---------------------  558
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  667  TESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTEIGMIGSKPFSTVKYKNEEEEVVPPRPPLPRSYDFTEQP  740

Query  559  ------------------------------------------GPDYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEPVS  590
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  PIIPPLPSDSSSLLCYSRGPVHLPEEKKMYQVQGYPRNGSHCGPDYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEPVS  814

Query  591  EIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMMDLRTERPRSAVEQLCLAESTRPRMTVEEQM  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  EIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMMDLRTERPRSAVEQLCLAESTRPRMTVEEQM  888

Query  665  ERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQTRRRDDKELDTAIRENDVKPDHETPATEIV  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQTRRRDDKELDTAIRENDVKPDHETPATEIV  962

Query  739  QLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEHPE  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  QLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEHPE  1036

Query  813  ENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV  1098